疾病标志物

搜索
登录

疾病标志物

文章数：3篇

药物-组学关联

Nature子刊：利用深度学习模型挖掘药物与多组学数据间的关联

先前多项研究已经证明测序技术和多组学的快速发展，极大促进了疾病标记物的识别和精准医学的发展，但有效整合多组学数据和表型数据的规模和异质性，并且进一步深入挖掘数据间的关联仍存在较大地挑战。近日，丹麦哥本哈根大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究，开发了一个基于深度学习的多组变分自编码器（MOVE），并且将这一方法应用于789名新诊断的2型糖尿病患者的多组学表型数据，以探究药物与组学表型间的关系。发现MOVE能够有效整合处理多组学和表型数据，并能更灵敏地挖掘出药物-组学间的关联，其中二甲双胍和奥美拉唑对多组学数据影响最明显，值得关注。

药物-组学关联 T2D患者研究论文基础研究深度学习模型

人类肠道菌群数据库

陈卫华+赵兴明+赫丽杰：实现疾病标志物识别和跨数据集比较的人类肠道菌群数据库GMrepo v2

GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库，其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性，并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2，在这个新版本中，作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。最重要的是，作者添加了疾病标记识别和已识别标记的跨项目/表型比较。GMrepo v2 可在以下网址免费获得：https://gmrepo.humangut.info。

人类肠道菌群数据库疾病标志物宏基因组学测序表型

肠道微生物

Nature子刊：肠道菌群组成或可成为健康和疾病的标志物

人体肠道菌群的变化可以反映宿主的生活方式和行为，影响血液中疾病生物标志物的水平。了解肠道菌群和宿主表型之间的关系对于理解健康和疾病至关重要。Nature Communications近期发表的文章，通过对3400名的肠道菌群和宿主表型特征进行分析，揭示出宿主饮食、生活方式、临床血液生物标志物和肠道菌群之间的互作关系，为将来研究宿主-微生物互作提供参考。

肠道微生物人群研究健康标志物疾病标志物