口腔噬菌体

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口腔噬菌体

康禹+王娟：口腔链球菌噬菌体增多是自闭症典型特征

自闭谱系障碍（ASD)是一种复杂的神经性和发育性疾病。由于对其病理机制认识的不足，目前没有特别有效的临床干预手段。近年来的研究发现，ASD的一个主要特征是在大脑和肠道中的慢性炎症反应，表明肠道菌群与ASD的发生关系密切。而作为与肠道菌群关系密切的口腔菌群也被证明与ASD的发生密切相关。影响菌群的构成一个重要的因素是人体共生的噬菌体的组成，但目前对于共生噬菌体与ASD的发生是否相关并不清楚。近期中国科学院北京基因组研究所康禹课题组和北京大学王娟课题组联合在NPJ Biofilms and Microbiomes上发表了其对ASD研究的最新成果，他们发现ASD患者口腔噬菌体丰度和多样性显著降低，而链球菌噬菌体丰度增加，该噬菌体毒理因子和链球菌丰度的增加与ASD的发生显著正相关。这一研究成果为口腔-大脑轴提供了新的证据，为通过改善口腔菌群而干预ASD提供了科学依据。

口腔噬菌体链球菌噬菌体口脑互作自闭症谱系障碍（ASD）研究论文

Nature子刊：长读长纳米孔宏基因组测序，揭示口腔噬菌体与宿主细菌的相互作用

目前尽管一些宏基因组学研究已经聚焦于口腔噬菌体上，但其依赖于短读长测序。该研究中，作者使用PromethION测序仪进行了人类唾液的长读长宏基因组学研究，其分析整合了PromethION和HiSeq的数据（每个样品> 30 Gb且人类DNA污染少），可鉴定出数百个病毒重叠群。本文中作者的分析显示了增强的桥接功能，以及将噬菌体放置在其宿主基因组环境中并实现其分类学分类的能力，其分析还确定了一个链球菌噬菌体/原噬菌体组和9个巨型噬菌体/原噬菌体。该研究证明了利用PromethION进行的长读长宏基因组学研究在发现噬菌体及其与宿主细菌相互作用中的作用。

长读长宏基因组学口腔噬菌体宿主细菌重叠群