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读长覆盖率
文章数:1篇
单核苷酸多态性(SNPs)
Nature子刊:使用GT-Pro快速准确地对人体肠道菌群进行宏基因分型
本研究开发了GenoTyper for Prokaryotes(GT-Pro),这是一套对来自基因组的 SNP 进行编目,并使用独特的 k-mers 对来自宏基因组的这些 SNPs进行快速基因分型的方法,与使用读长对齐的方法相比,GT-Pro 更准确,速度快两个数量级,作者构建了一个GT-Pro数据库,基于大约25,000个宏基因组样本,并展示了GT-Pro如何用于数千种菌群的菌株水平探索。
单核苷酸多态性(SNPs)
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