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细菌转录组
文章数:2篇
细菌转录组
Nature子刊:多形拟杆菌的高分辨率转录组图谱
类杆菌属细菌是人类肠道菌群的常见成员,是降解肠道多糖的重要细菌。Nature Communications近期发表的文章,利用差异RNA测序发布了多形拟杆菌的单核苷酸分辨率的转录组图谱,并揭示出其中的小RNA调控——N-乙酰-D-氨基葡萄糖的敏感性可诱导GibS的表达,进而改变代谢酶的转录水平。
细菌转录组
多形拟杆菌
小RNA调控
脆弱拟杆菌
Nature子刊:hsRNA-seq揭示出脆弱拟杆菌在结肠不同空间的生理机能
《Nature Microbiology》发表的文章,利用杂交选择RNA测序(hsRNA-seq)对分布在小鼠结肠腔、粘液或上皮组织的脆弱拟杆菌进行转录组分析,揭示出其在结肠不同空间的生物机能。同时,与传统RNA-seq相比,hsRNA-seq对粘液和组织的脆弱拟杆菌基因组的读写能力分别提高了48倍和154倍,可对不同生物地理位置进行高保真的比较。
脆弱拟杆菌
Bacterial host response
microbial ecology
Microbiome
RNA sequencing