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Bioinformatic pipeline
文章数:1篇
菌群分析方法
评估16S rRNA基因测序分析方法的框架
有多种生物信息学下游分析流程可用于分析16S rRNA基因扩增子测序,但尚无研究使用环境混合物评估16S rRNA基因测序结果的准确性。在《Microbiome》发表的这项研究中,作者开发了一种评估16S rRNA基因测序分析方法的框架,该框架利用一种新颖的两样品滴定混合物数据集和指标来评估计计数型表的定性和定量特征,并通过评估三个主流分析流程生成的计数表演示了该框架的分析结果。该框架是评估16S rRNA标记基因生物信息学方法的宝贵资源,并将帮助科学家为其标记基因分析选择合适的分析方法。
菌群分析方法
16S rRNA gene
Assessment
Bioinformatic pipeline
Normalization