非加权 UniFrac 距离

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非加权 UniFrac 距离

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无监督聚类

评测菌群数据无监督聚类方法的性能决定因素

本文系统地比较了菌群分析中常用的 β 多样性和聚类方法。作者将这些应用于四个已发布的数据集，其中可以在样本组之间看到高度不同的微生物组，以及在组之间分离不太清晰的临床数据集。作者表示没有现有的聚类方法可以在所有数据集中普遍表现最佳，并提出了 BC(Bray Curtis) 和 UU (unweighted UniFrac) 的组合指标，利用了这两个指标的互补优势。

无监督聚类 Bray Curtis距离非加权 UniFrac 距离 β多样性