基因组质量

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文章数：2篇

宏基因组组装基因组（MAGs）

Nature Reviews：评估MAG质量的不同工具和策略（评论）

随着测序技术和生物信息学工具的快速发展，如今微生物相关研究已经产生了大量的宏基因组组装基因组（MAG），如何评估这些基因组的完整度和污染率，一直是该研究领域的重要课题。近日，发表在Nature Reviews Microbiology的一篇报道，介绍了用于评估微生物组研究中生成的MAG的质量的不同工具和策略（CheckM、CheckM2及uBin），为后续研究人员进行基因组质量评估提供了指导，值得关注。

宏基因组组装基因组（MAGs）质量评估其他基础研究宏基因组工具

宏基因组分箱

Nature子刊：宏基因组分箱过程中单覆盖和多覆盖效果有何不同？

宏基因组分箱已逐渐成为探索微生物组成与功能必不可少的技术手段。近日，英国爱丁堡大学研究人员在Nature methods发表最新研究，对同一组样本进行了单覆盖和多覆盖分箱比较，发现多覆盖分箱比单覆盖分箱能产生更好的结果，且能够识别其他方法忽视的污染序列和嵌合分箱。尽管多覆盖分箱需要更多资源，但它是一种更优越的方法，应始终优先于单覆盖分箱进行。

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