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肠道微生物蛋白酶解
文章数:1篇
宏蛋白质组学
Microbiome:严志祥等深挖IBD肠道菌群蛋白酶解特征
蛋白酶解调控能通过快速降解错误折叠蛋白和激活调节蛋白,使得肠道微生物快速响应肠道环境的动态变化。在常规的宏蛋白质组学数据分析中通常不会纳入半胰蛋白酶解肽,然而这些肽主要源于内源性的蛋白酶解作用,可以为研究肠道菌群的特征和变化提供一个独到的视角。中山大学附属第五医院严志祥、单鸿、李啸峰和澳门大学燕茹与研究团队,近期在Microbiome发表文章,报道了一种以半胰蛋白酶解肽为核心的宏蛋白质组挖掘方法,采用综合的宏数据库、两步多引擎数据库搜索和高分辨率质谱数据集,可以分析人肠道菌群的蛋白酶解特征。该研究以炎症性肠病(IBD)为例,首次从公共数据集中发掘肠道菌群的蛋白酶解特征,在微生物种类和蛋白质丰度之外提供了IBD菌群变化的另一个层面的信息。该方法可用于研究宿主-菌群互作的调控,推荐专业人士参考。
宏蛋白质组学
肠道菌群
肠道微生物蛋白酶解
炎症性肠病