多组学技术

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张和平团队Nature子刊：腺嘌呤甲基化在副干酪乳酪杆菌生理学中有何作用？

多项研究已经报道，在细菌中DNA甲基化是一种普遍的表观遗传机制，其中6-甲基腺嘌呤（6mA）是最普遍的一种，在调节基因表达和形成致病菌的宿主细胞方面起作用，但其在副干酪乳酪杆菌中的生理功能却鲜为人知。近日，内蒙古农业大学张和平及团队在Nature Communications发表最新研究，通过多组学和高通量染色体构象捕获（Hi-C）技术，揭示了副干酪乳酪杆菌表观遗传修饰的分子和功能作用，极大地促进了益生菌领域的最新前沿研究，值得关注。

甲基化益生菌研究论文基础研究表观遗传

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群落生态方法分析组学数据

随着多组学技术的不断发展，人们可以通过元条形码研究、宏基因组学、元转录组学、元代谢组学以及宏蛋白组学等多种技术对待检测样本的分子池进行测量，生成海量的多元数据集，进而对这些数据集进行分析，从而找到规律，解决科学问题。很显然，对于这些海量的数据集的分析，传统的单分子的分析方法已经不再适用。因此，对于这些数据集的分析，人们借鉴了传统群落生态学的分析方法，即找出这些分子的ɑ和β多样性，从而评估分子特征对样本特征的影响。然而，待检测样本和数据采集的方法和过程均会产生偏差和数据噪音，这些偏差和噪音会严重影响对分子多样性的评估，进而影响结论的准确度。近期一篇发表在Microbiome的评论文章对实验技术产生的偏差和数据噪音对分子多样性的影响进行了探讨，讨论了在何种条件下这些偏差会显著影响对数据集的ɑ和β多样性的分析，进而强调如何采用群落生态学中常用的新方法来改进多元分子数据的解释和集成。

多组学技术元数据集影响因素分子生态学（MME）数据技术偏差