基因组集

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人类肠道菌群

宏基因组数据构建的人肠道原核微生物基因组集HumGut

本研究创建一个最通用的健康人类肠道原核基因组集合，用于作为菌群研究的参考数据库。包括来自人类肠道的 MAG 和普通的 RefSeq 基因组。HumGut 集合包含 > 30,000 个基因组，以 97.5% 的序列相似性水平进行聚类，并按人类肠道中流行率排序。作者展示了来自 IBD 患者的宏基因组同样很好地比对到这个基因组集，表明这个参考数据库也与用于获得 HumGut 的宏基因组参考数据库之外的研究相关。所有数据和元数据以及有用的代码都可以在 http://arken.nmbu.no/~larssn/humgut/ 上找到。

人类肠道菌群基因组集数据库