Jinlong Ru

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文章数：2篇

用于病毒宏基因组数据分析的新工具ViroProfiler

噬菌体通过调节细菌群落，在大多数生态系统的维持和功能中发挥着核心作用。然而，由于缺乏健全的生物信息学标准，目前对其多样性的理解仍然有限。近日，德国亥姆霍兹慕尼黑中心病毒所Li Deng及团队在Gut Microbes发表最新研究，开发了一种用于病毒宏基因组数据分析的新工具ViroProfiler（https://github.com/deng-lab/viroprofiler），可对病毒组数据进行灵活且可重复的分析，并显著缩短处理时间。此外，ViroProfiler可以大大提高病毒组研究中的数据分析质量，并为更标准化地描述复杂生态系统中的病毒群落奠定新基础，值得关注。

ViroProfiler 病毒组研究论文基础研究生信工具

Cell子刊：发育不良儿童的肠道噬菌体特征

发育不良在全球范围内影响约22%的5岁以下儿童，这些患儿的肠道菌群以变形菌门细菌增多为特征，但尚不清楚其肠道噬菌体的特征和作用。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究，对比了不同年龄段的发育不良患儿与正常儿童的肠道菌群和噬菌体组成，发现低龄儿（≤23月龄的未断奶的婴幼儿）的肠道噬菌体有更强的调控肠道细菌的能力，表明噬菌体或许参与了发育不良患儿的肠道菌群改变，提示对发育不良儿童进行早期肠道菌群干预可能更加有效。

发育不良噬菌体 gut microbiome Bacteriophages metagenomics