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深度学习算法
文章数:1篇
rRNA 序列
测序数据鉴别和去除rRNA序列利器RiboDetector
rRNA序列污染是广泛存在于各类高通量测序数据中的。除了在实验建库过程中对文库进行去核糖体的处理,数据分析层面也可通过一些序列比对的策略去除。本研究中,作者基于深度学习算法开发了高效准确去除核糖体序列的工具-RiboDetector,其是基于深度学习的BiLSTM(一款双向的循环神经网络架构)开发的软件,其可以快速准确地识别转录组、宏基因组、宏转录组、非编码 RNA 和核糖体测序数据中的 rRNA 读长,RiboDetector 可在 https://github.com/hzi-bifo/RiboDetector 获得。
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