Patrick H Degnan

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Patrick H Degnan

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可移动遗传元件

Cell子刊：一类可移动遗传元件，或帮助拟杆菌在肠道中获得竞争优势

由可移动遗传元件（MGEs）的水平转移，促进形成了人类肠道微生物组的功能和基因组多样性。一些MGEs编码的的基因，可能帮助细菌进行自我防御（如抗生素抗性），或提高细菌竞争资源（如维生素）的能力。维生素B12和相关化合物（类咕啉）是使肠道菌群中的拟杆菌成员定植的关键营养物质。Cell Reports发表的这项研究，从拟杆菌中鉴定出一类MGEs，编码了拟杆菌中的维生素B12转运体，并通过体外和体内实验证明了水平基因转移在塑造拟杆菌对B12等营养小分子的竞争中的重要性。

可移动遗传元件拟杆菌门肠道菌群水平基因转移维生素12

Cell子刊：噬菌体的溶源性感染影响其细菌宿主的转录及功能

肠道相关噬菌体可改变其细菌宿主的丰度及活性，从而影响人体健康与疾病。温和噬菌体占据了肠道病毒组中的大部分，而噬菌体的溶源性感染的作用尚未完全明确。Cell Reports上发表的一项最新研究，鉴定出了一种属于Salyersviridae病毒科的拟杆菌属噬菌体BV01，并发现BV01对普通拟杆菌的溶源性感染可导致其整合至宿主TspO蛋白的启动子区域，以抑制胆盐水解酶的表达，从而改变普通拟杆菌的胆汁酸代谢活性。

噬菌体 Bacteroides gut microbiome Bacteriophage temperate phage. bile acids. host-microbe interactions. phage-host interactions