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文章数:1篇
菌群
Cell子刊:基于深度学习的微生物基因组小蛋白编码基因的自动预测和注释
使用现有的研究工具常常忽略了小蛋白质,Durrant和Bhatt使用深度学习模型来改进对人类菌群中常见的小蛋白质的检测。为了方便注释特定的小型开放阅读框(smORFs),本文引入了SmORFinder。该工具结合了每个smORF家族的隐马尔可夫模型和深度学习模型,这些模型可以更好地推广到训练集中未被见到的smORF家族,从而丰富了对Ribo-seq翻译信号的预测。该注释工具可免费获得,并且可以重新分析成千上万个公开可用的基因组。
菌群
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