Min Li

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陈卫华+赵兴明等：基于肠菌的机器学习模型对20种疾病的诊断性能如何？

肠道菌群被逐渐用作非侵入性疾病预筛查的生物标志物和疾病干预的目标。然而，由于肠道菌群会受到多种因素影响，因此关于不同队列中肠道菌群失调的可重复性仍存在争议。近日，复旦大学赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Gut Microbes发表最新研究，系统地评估了基于肠道菌群的机器学习分类器对20种疾病的跨队列分类性能，发现可以使用肠道菌群作为独立的、跨队列的诊断工具，但仅用于少数肠道疾病。

肠道菌群疾病诊断研究论文基础研究机器学习

人类肠道菌群数据库

陈卫华+赵兴明+赫丽杰：实现疾病标志物识别和跨数据集比较的人类肠道菌群数据库GMrepo v2

GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库，其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性，并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2，在这个新版本中，作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。最重要的是，作者添加了疾病标记识别和已识别标记的跨项目/表型比较。GMrepo v2 可在以下网址免费获得：https://gmrepo.humangut.info。

人类肠道菌群数据库疾病标志物宏基因组学测序表型