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司同
中科院深圳先进院合成生物学研究所研究员
博士，研究员。致力于合成生物前沿技术开发，如自动生物“智造”、全基因水平编辑、高通量质谱筛选等，用于燃料、药物等重要分子的研究与生产。前期成果在Nature Communications, JACS, Metabolic Engineering等国学术期刊发表SCI论文20余篇，“谷歌学术”引用超过1000次，H因子16。
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司同+陈永灿等：菌株高通量质谱筛选方法（综述）
尽管质谱分析具有高灵敏度、高特异性、无标记等优点，但传统色谱-质谱方法通量低、周期长、无法满足菌株快速筛选的需求。近日，中国科学院深圳先进技术研究院陈永灿、司同及团队在Current Opinion in Biotechnology发表最新综述，聚焦工程菌株的高通量质谱筛选方法，从微生物培养体系、自动化样品制备、高通量质谱仪器、菌株开发应用等多方面系统阐述，并对关键挑战和未来趋势进行了展望，值得关注。
2022-09-21
王欢+司同：新型肽酶参与羊毛硫肽抗生素的生物合成
羊毛硫肽化合物是由核糖体合成并经过翻译后修饰得到的一大类肽类天然产物。这类化合物具有丰富的结构和生物活性多样性，为活性药物研究和开发提供重要的来源。南京大学的王欢课题组和中国科学院深圳先进技术研究院的司同课题组合作在Angewandte Chemie International Edition上发表的一项研究，解析了基因簇内S8家族丝氨酸肽酶AmyP如何参与前导肽移除和抗生素活性的激活。
2022-01-26
让“菌群挖宝”通量提高1万倍？我们这样干！
什么是自动化合成生物技术？它将如何助力人类微生物天然产物研究？
2021-02-18
《热心肠日报》解读 更多>>
司同+陈永灿等：菌株高通量质谱筛选方法（综述）
① 质谱 (MS) 是一种无标记模式（灵敏度高、特异性好），提高MS分析通量关键是省略色谱分离步骤，微生物样品可通过自动进样器、超声波、微流控等手段进入仪器；② 筛选菌株库常用检测方法有MALDI MS、ESI MS和微流控 MS等；③ 培养基成分复杂、细胞代谢会导致除目标物外其他物质变化、流动注射前需将发酵液中液体和细胞分离等因素制约MS测定效果；④ 先基于表面MS筛选琼脂菌落或液滴培养物，再使用机器人清理微孔板培养物进行精确ESI MS分析。
2022-04-27
王欢+司同：新型肽酶参与羊毛硫肽抗生素的生物合成
① 大鼠肠道细菌解淀粉芽孢杆菌中amy生物合成基因簇由羊毛硫肽合成酶amyKC、S8家族丝氨酸肽酶amyP、转运蛋白amyT和7个含不同前导肽（LP）的羊毛硫肽amyA(I)-(VII)组成；② AmyKC可催化AmyA(I)和AmyA(V)形成III型羊毛硫肽特有的labionin结构；③ 重组AmyP可特异性切割修饰后AmyA(I)-(VII)的LP，S395是关键位点；④ LP的保守基序(T/S/A)EVE对AmyP的底物识别是必需的；⑤ 去除LP的修饰后AmyA(I)仅对19种肠道细菌中的巨大芽胞杆菌R28菌株有抑菌活性。
2021-12-10
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注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者
2023
CADeep Mutational Scanning of an Oxygen-Independent Fluorescent Protein CreiLOV for Comprehensive Profiling of Mutational and Epistatic Effects
ACS SYNTH BIOL, 10.1021/acssynbio.2c00662
CAEnabling technology and core theory of synthetic biology
Sci China Life Sci, 10.1007/s11427-022-2214-2
2022
CAProtein engineering via Bayesian optimization-guided evolutionary algorithm and robotic experiments
BRIEF BIOINFORM, 10.1093/bib/bbac570
CABiosynthesis of Hybrid Neutral Lipids with Archaeal and Eukaryotic Characteristics in Engineered Saccharomyces cerevisiae
ANGEW CHEM INT EDIT, 10.1002/anie.202214344
CARobotic Construction and Screening of Lanthipeptide Variant Libraries in Escherichia coli
ACS SYNTH BIOL, 10.1021/acssynbio.2c00344
CAEnhanced Rishirilide Biosynthesis by a Rare In-Cluster Phosphopantetheinyl Transferase in Streptomyces xanthophaeus
Microbiol Spectr, 10.1128/spectrum.03247-22
CAProfiling of d-alanine production by the microbial isolates of rat gut microbiota
FASEB J, 10.1096/fj.202101595R
CADirected evolution of a cyclodipeptide synthase with new activities via label-free mass spectrometric screening
CHEM SCI, 10.1039/d2sc01637k
发明专利
高效异源途径的组合设计，US2011/054650
头衔
中科院深圳先进院合成生物学研究所研究员
简介
博士，研究员。致力于合成生物前沿技术开发，如自动生物“智造”、全基因水平编辑、高通量质谱筛选等，用于燃料、药物等重要分子的研究与生产。前期成果在Nature Communications, JACS, Metabolic Engineering等国学术期刊发表SCI论文20余篇，“谷歌学术”引用超过1000次，H因子16。
教育经历
清华大学，获得学士学位
美国伊利诺伊大学香槟分校，获得博士学位
工作经历
现任中科院深圳先进院合成生物学研究所研究员
主要研究领域与方向
合成生物前沿技术开发，如自动生物“智造”、全基因水平编辑、高通量质谱筛选等，用于燃料、药物等重要分子的研究与生产。
所获荣誉
国家优秀自费留学生；
Baxter青年科学家奖；
美国化工协会AIChE年会分会场主席等荣誉。
相关专家
戴俊彪
中国农业科学院深圳农业基因组所 研究员
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中国科学院深圳先进技术研究院研究员
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中国科学院深圳先进技术研究院研究员
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海军军医大学基础医学部教授
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南京医科大学第二附属医院副院长
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上海交通大学医学院附属仁济医院-上海市免疫治疗创新研究院研究员
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