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metagenomic assembly
文章数:3篇
宏基因组组装基因组(MAGs)
人类和非人类灵长类动物 (NHP) 微生物组的比较宏基因组分析
Genome Biology发表的文章,比较分析了人类和非人类灵长类动物 (NHP) 微生物组的宏基因组,扩展了人类与NHP相关的微生物多样性,能够更好地表征灵长类动物菌群,深入进行人类和NHP的比较研究。
宏基因组组装基因组(MAGs)
非人类灵长类动物肠道菌群
metagenomic assembly
Non-human primates microbiome
Microbiome sharing
人肠道细菌
Cell子刊:揭秘西化人群中缺乏的Prevotella copri
Prevotella copri是常见的人类肠道细菌,尤其存在于非西化人群中,这种菌在健康与疾病中的作用仍有不小的争议。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究,分析了超过7000个宏基因组中>1000个P. copri基因组,结合对古人类化石样本的分析,充分揭示了这种菌的种内多样性和在不同人群中(西化vs非西化)的存在情况,及其与人类共生的进化史,表明西化进程(尤其是相关的饮食变化)可能导致了这种菌在人类肠道中不断减少。
人肠道细菌
human microbiome
metagenomics
Prevotella copri
comparative microbial genomics
人类微生物组
Cell:9428个人体宏基因组!探索全球人类微生物组中的广大未知
Cell发表的一项微生物组最新研究,对32个国家不同人群、生活方式、年龄段和身体部位(粪便、口腔、皮肤和阴道)的9428个人体宏基因组进行大规模组装,发现了大量的未知微生物物种和基因组,使人类微生物组的参考基因组规模翻了1倍,大大扩展了人们对人体微生物组多样性的认知,将为后续研究——特别是在菌株水平的肠道和口腔微生物组研究,提供很大助力。
人类微生物组
human microbiome
metagenomics
metagenomic meta-analysis
metagenomic assembly