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死亡时间
文章数:12篇
随机森林回归模型
Genes:如何利用菌群数据预测死亡时间
确定准确的死亡时间,有助于确认死者和排查凶手。近期Genes[IF:3.6]发表的一项研究,用机器学习方法建模,通过分析菌群数据,可精确预测死亡时间,相关专业人士或许可以参考一下。
随机森林回归模型
死亡时间
Random Forest regression
Decomposition
Microbiome
法医学
TB:用于法医学的微生物工具
IF达到12分的杂志,又一次关注法医学中微生物的应用,很值得认真读一读。
法医学
机器学习
代谢组学
微生物组
痕量证据
死亡微生物组
PLoS One:利用尸体皮肤菌群估计死亡时间
又是“恐怖”的死亡微生物组相关文献,这次关注皮肤菌群在评估死亡时间中的作用,推荐阅读。
死亡微生物组
机器学习
尸体皮肤菌群
死亡时间
YanDan Ren
刑事案件
SR:人死后,不同器官微生物有什么演替时间表?
① “死亡微生物组”是一个相对较新的概念,研究对象是人死后定殖在五脏六腑的微生物,其中以专性厌氧的梭状芽胞杆菌为主;② 研究刑事案件中27具遗体,死亡时间在3.5-240小时之间;③ 通过16S rRNA基因测序分析这些尸体内各部位的微生物,发现了统计学上具有显著性的依赖于时间、器官和性别的差别;④ 每个器官的特征微生物的数量和丰度,可为法医微生物学家提供估计死亡时间的新数据。
刑事案件
法医
16s rRNA测序
死亡时间
Herbert L DuPont
刑事案件
FM:什么是死亡微生物组?(综述)
① 法医微生物学家在研究人死后体内微生物的动态和协同变化,研究对象是死亡微生物组和表面腐烂微生物群落,这包括遗体表面里和/或表面上的微生物群落;② 现有研究已经初步成熟,可帮助鉴定人死亡后微生物组的结构和功能;④ 人死后的腐烂伴随着包括化学降解和细胞自我分解在内的复杂过程,也伴随着非生物/生物因素影响下的酶引起的肠内容物释放;⑤ 这些因素可能对人死后微生物群落具有预测作用,可用于法医学研究和应用。
刑事案件
法医
16s rRNA测序
死亡时间
Arnold Berstad
尸体分解
Science:我们死后,被哪些细菌分解?
今年1月Rob Knight在Science的“恐怖”之作,结果大概是,不管你死后被埋在哪里,分解你尸体的细菌大概都是类似的。。。
尸体分解
微生物群
法医
死亡时间
刑事案件
苍蝇
IJLM:分解人尸的细菌,是苍蝇喜欢的?
① 在两具放置在室外的尸体中的不同部位取样本,用454焦磷酸测序分析细菌16S rRNA基因的可变区3-5;② 在降解过程中,每具尸体所有部位的细菌群落结构都发生了变化;③ 在膨胀和排气期,直到组织开始脱水和完全清除,Ignatzschineria和Wohlfahrtimonas这样的与苍蝇有关的细菌很普遍;④ 脱水和骨架化后,与土壤有关的细菌,如不动杆菌属变得普遍。
苍蝇
土壤微生物
不动杆菌
刑事案件
法医
死亡时间
JMM:不同方法分析不同尸体器官的微生物,有差别么?
① 研究人类尸体中脾脏、肝脏、大脑、心脏和血液中的死亡微生物组;② 同一具尸体中,不同器官的死亡微生物组很相似;不同尸体之间因死亡时间、死亡和/或环境因素不同,死亡微生物组不尽相同;③ 对两种不同的16S rRNA基因扩增方法进行比较,并对四具尸体来源的扩增子进行测序;④ 传统DNA提取方法可得到更多的扩增子,两种提取方法间16S rRNA基因的物种多样性指数则无显著区别;⑤ 尸体中梭菌占优的组织器官有更长的降解期。
死亡时间
16s rRNA测序
刑事案件
法医
DNA提取方法
微生物功能活性
PLoS One:降解尸体的微生物在哪个季节活性最高?
① 利用Biolog EcoPlates™测量脊椎动物腐肉分解过程中,利用29种不同碳源的微生物群落的功能变化;② 利用焦磷酸测序分析细菌群落组成,鉴定与群落功能变化有关的关键物种;③ 分解过程中,春、夏、冬三季的微生物功能活性升高,秋季降低;④ 测定食尸节肢动物定殖的影响,发现2011年的微生物功能活性最高;⑤ 但比较2010和2011年,从尸食性昆虫定殖尸体中分离的微生物群落的功能趋势不一致,说明还需要有进一步的机制研究。
Biolog EcoPlates
微生物功能活性
季节变化
刑事案件
法医
尸体分解膨胀期
PLoS One:尸体分解膨胀期起止,细菌群落有何不同?
① 在东南德克萨斯州应用法医学研究所,研究者放置了两具尸体,使其在自然条件下分解;② 分别在包括尸体内部在内的不同身体部位,取分解膨胀期开始和结束两个时间点的样本,对16S rRNA基因进行焦磷酸测序;③ 所有部位样本中,都发现从需氧细菌转变为厌氧细菌的变化,两具尸体间、同一具尸体的不同部位间、同一部位两次取样时间点间的微生物群落组成都不一样;④ 有一些物种与用培养观察到的物种一致,但许多物种是全新的。
尸体分解膨胀期
刑事案件
法医
16s rRNA测序
死亡时间
微生物时间表
eLife:利用微生物时间表,精准预估死亡时间
① 在每一件死亡调查中,确认死亡时间都非常关键,但现有技术可能受限于一系列的错误和偏倚,比如倚仗法医昆虫学的结果,可能会有数天甚至数月的偏差;② 在小鼠模型中,研究者发现死后微生物群落的变化是动态、可测并且是可重复的,可用于预估出3-48天的死亡时间;③ 这些对腐尸系统中细菌和真菌微生态的理解,为估计死亡时间提供了一个新的法医工具。
微生物时间表
法医昆虫学
法医微生物学
刑事案件
法医
刑事案件
IJLM:高通量测序助力法医通过微生物鉴定死亡时间
① 通过焦磷酸测序,检测并确定尸体腐烂进程中不同时间点的细菌群落丰度,通过热叠加模型,鉴定出对于预估生理学时间非常重要的细菌分类;② 尸体分解过程中,在门和科水平上,细菌群落结构的分类单元丰度和相对丰度模式都有显著差别;③ 在整个尸体分解过中,门和科的总分类单元丰度是不断下降的;④ 开发了稳定的预测模型,在2-3小时范围内,可描述94.4%的尸体埋入土中的时间。
刑事案件
法医
16s rRNA测序
死亡时间
死亡微生物组