Frédéric Raymond

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Frédéric Raymond

文章数：4篇

饮食-菌群互作

饮食干预快速地影响肠道菌群和脂质代谢

人体细胞或肠道菌群产生的生物活性脂质可能在健康和疾病中发挥重要作用。膳食摄入是肠道菌群、菌群代谢产物短链脂肪酸（SCFA）和支链脂肪酸（BCFA）的产生以及宿主内源性大麻素信号的关键决定因素，这些都与代谢疾病有关。Microbiome近期发表的文章，为确定引入饮食是否会影响宿主对短期饮食干预的反应，科研人员在健康参与者中设置了一项纵向固定序列营养研究。结果显示，某些肠道菌群及其代谢产物脂质对饮食变化表现出快速的响应。

饮食-菌群互作脂质

宏基因组分析方法

培养富集+测序可揭示肠道细菌核心及附属基因

《Microbiome》上发表的一项最新研究，报道了结合液体培养与鸟枪法测序，可研究肠道菌群中低丰度细菌的基因组，并通过此方法鉴定出了阴沟肠杆菌及大肠杆菌的耐药基因，并可推断基因水平转移可能性。该方法对于研究肠道细菌耐药性以及获得方式具有参考价值。

宏基因组分析方法 Microbiome antibiotic resistance Pangenome Metagenomics assembly comparative genomics

抗生素耐药性

Gut Microbes：抗生素使用后，宏基因组序列旧去新来

使用头孢丙烯7天，宏基因组序列显著缺失，3个月后新序列出现，而这些序列在之前没有出现过，很多与耐药性有关。抗生素对菌群的影响，可见一斑。

抗生素耐药性宏基因组测序比较宏基因组 Wei Li Xiaogang Luo

ISME：抗生素使用，菌群决定效果，七天出耐药性！

① 给18名健康志愿者使用头孢丙烯，发现抗生素治疗导致肠道菌群结构改变具有特异性、可重复和可预测的特点；② 18名受试者中，16名肠道中弓形梭菌丰度一致增加；③ 抗生素治疗后条件致病菌阴沟肠杆菌显著增加，与初始菌群多样性低及拟杆菌肠型有关；④ 抗生素改变受试者的耐药基因库，且头孢丙烯对个体的影响具有特异性；⑤ 抗生素给药7天后观察到耐药基因出现，且一些受试者的β-内酰胺酶blaCfxA-6的点突变增加；

抗生素肠道菌群