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转座子
文章数:5篇
细菌基因组编辑
马延磊+晁彦杰等:详解肠道细菌的遗传操作工具(综述)
肠道菌群与健康和疾病密切相关,但人们对菌群基因-宿主相互作用的因果机制仍知之甚少。这在一定程度上是受限于肠道细菌的遗传操作工具。复旦大学附属肿瘤医院马延磊和中国科学院上海巴斯德研究所晁彦杰与团队在Trends in Microbiology发表重要综述,概述了开发肠道细菌遗传操作工具的挑战和进展,包括DNA递送、基于转座子和CRISPR的基因组编辑,以及它们在菌群相关人类疾病(如癌症和代谢性疾病)的医学研究中的应用。值得专业人士关注。
细菌基因组编辑
肠道菌群
工程菌
遗传操作工具
宿主-微生物互作
RNA病毒测序
赵方庆+赵翔:开发高效捕获RNA病毒基因组的宏转录组建库测序新技术
该研究构建了宏转录组建库测序新技术Tn5-mediated RNA sequencing with rRNA Removal (TRIM)。鉴于病原鉴定要求很强的时效性,该技术基于Tn5转座子酶切割DNA/RNA杂化双链的新特性,大幅简化宏转录组建库流程,缩短建库时间,并通过增加去除人和细菌rRNA的步骤有效提高RNA病毒检测的灵敏度,其是一种快速、价廉,对RNA病毒更敏感的宏转录组测序建库方法,适用于临床上对SARS-CoV-2共感染的研究,并可用于帮助发现和鉴定未知病原。
RNA病毒测序
反转录
TRIM
SARS-CoV-2
宏转录组
慢生根瘤菌
Nature子刊:国内团队揭示大豆与根瘤菌匹配性的进化及其分子机制
2021年1月15日,河南大学作物逆境适应与改良国家重点实验室王学路教授团队和华中农业大学李友国教授在Nature Plants上发表了题为Glycine max NNL1 restricts symbiotic compatibility with bradyrhizobia via root hair infection in soybean的研究论文,揭示了大豆与根瘤菌共进化过程中,根瘤菌由裂隙侵染向根毛侵染方式转化的遗传、分子和进化机制,这种侵染方式的转变对于增强大豆共生固氮能力和提高大豆产量起到了重要作用,为大豆高效固氮的分子设计育种提供了重要理论依据和目标基因。
慢生根瘤菌
根毛侵染
R基因
转座子
固氮酶活
细菌基因组编辑
Nature子刊:高效的多重细菌基因组编辑工具
现有的细菌中千碱基大小的DNA序列的定点整合技术效率低、依赖重组,其应用收到限制。Nature Biotechnology近期发表的文章,开发出一种引导RNA辅助转座子靶向插入(INTEGRATE)技术,可实现大片段DNA(10-kb)在细菌基因组的高精度插入,同时利用CRISPR阵列可实现多位点不同片段的特异性整合,是一种多重、千碱基规模的基因组编辑技术。
细菌基因组编辑
CRISPR-Cas9
转座子
单细胞基因组
Nature:人群和个体间的微生物组转座基因各不相同
也是最新Online的Nature文章,通过单细胞基因组和和宏基因组的结合,比较不同人群和个体微生物组中的转座基因,值得一读!
单细胞基因组
转座基因
转座子
饮食差异
基因重组