ITS

搜索
登录

ITS

文章数：3篇

Nature子刊：全新的微生物组分析平台QIIME 2正式发布

引用1.7万多次的微生物组分析流程QIIME发布已9年，无法满足当今大数据和可重复分析的要求。2016年发起的全新项目QIIME 2，基于Python3编写，集合了10个国家79家单位的112位作者共同参与，于2019年7月24日在生物技术顶级期刊Nature Biotechnology正式发表。该项目发表不是项目结束，而是刚刚开始，将会以每季度的速度进行大版本更新优化和增加新功能，而且也希望更多的国际同行加入，打造微生物组领域最强大的分析平台和知识库。该项目在发表前已经非正式引用近千次，现在大家可以优雅的引用它了。本月底将发布2019.7版本，年底发布2019.10版本，配套中文文档和视频教程也将在宏基因组公众号陆续更新，详见延伸阅读。

微生物组 QIIME2 软件刘永鑫白洋

Nature子刊：世界范围内土壤真菌群落中以子囊菌为优势型

真菌是土壤微生物群落的重要组成，是分解者中的先锋物种。Nature Communication中发表的这一篇论文从六大洲采集了235份土壤样本，利用ITS序列测序和宏基因组测序的方法，系统地鉴定了土壤中真菌群落的组成。发现子囊菌是全球土壤中中占主要的物种，其次是担子菌和未分类真菌。

土壤菌群土壤真菌土壤宏基因组 ITS Hirotaka Kawanabe-Matsuda

国际空间站中的细菌及真菌群落

《Microbiome》上发表的一项最新研究，对国际空间站中不同区域表面的细菌及真菌群落进行了鉴定，该研究有助于研究密闭、洁净空间中环境菌群状况，不仅有助于载人航天相关研究，对于医疗环境菌群研究也有参考价值。

环境菌群 16S rRNA Built microbiome Environmental surface ITS