宏基因组数据集

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宏基因组数据集

文章数：3篇

肠道细菌参考基因组

Nature子刊：人类肠道菌群参考基因组图谱的扩展揭示了数百种未知的物种

随着测序技术和生物信息学发展，研究人员可从宏基因组样本不断组装恢复肠道菌群基因组，构建了多项人类肠道菌群基因组参考数据集。近日，研究人员在Nature Communications发表最新研究，通过将5万多个宏基因组样本中新组装的MAGs与现有人类肠道菌群基因组结合，构建了含24万多个基因组的数据集（WIS数据集），揭示了数百种未知的物种。该数据集比目前UHGG和UNITN两大数据集的基因组质量更高、低丰度物种更丰富。总之，WIS数据集进一步扩大了人类肠道菌群参考基因组图谱，值得相关人员测试比对。

肠道细菌参考基因组宏基因组组装基因组 (MAGs) 研究论文基础研究宏基因组数据集

功能注释工具

eggNOG-mapper v2：宏基因组功能注释的最新软件和配套最新数据库

本文作者描述了 eggNOG-mapper 的重大升级版本eggNOG-mapper v2，其提供了比其前身更高效、通用且可扩展的自动化功能注释工作流程。GitHub 上提供了独立版本（https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper），以及大量文档和使用示例（https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper/wiki）。

功能注释工具宏基因组数据集基因预测重叠群

宏基因组数据集

TG：远古时代的基因，如何才能准确鉴定？（综述）

这是一篇关注在宏基因组数据中准确鉴定远古DNA序列信息的综述，文章里有相关流程的手把手指导，非常值得一读！

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