肠道细菌参考基因组

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肠道细菌参考基因组

Nature子刊：人类肠道菌群参考基因组图谱的扩展揭示了数百种未知的物种

随着测序技术和生物信息学发展，研究人员可从宏基因组样本不断组装恢复肠道菌群基因组，构建了多项人类肠道菌群基因组参考数据集。近日，研究人员在Nature Communications发表最新研究，通过将5万多个宏基因组样本中新组装的MAGs与现有人类肠道菌群基因组结合，构建了含24万多个基因组的数据集（WIS数据集），揭示了数百种未知的物种。该数据集比目前UHGG和UNITN两大数据集的基因组质量更高、低丰度物种更丰富。总之，WIS数据集进一步扩大了人类肠道菌群参考基因组图谱，值得相关人员测试比对。

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Nature：难培养的肠道细菌基因组有“话”要说

肠道中大部分微生物难以被培养。《Nature》近期发表研究，从人群粪便宏基因组中组装出60664个原核生物基因组草图，新发现了2058个菌种水平的新OTUs，并发现新OTUs与许多疾病存在相关性。该结果大大增加了已知肠道细菌种类，对于菌群分析相关各领域都有极大意义。

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华大基因团队：1520个人肠道单细菌参考基因组，助力菌群研究

华大基因的肖亮、贾慧珏和李俊桦与团队的重要研究，近期在Nature Biotechnology发表。该研究通过培养组学方法，从健康人粪便样本中获得1520个单菌基因组草图，对现有的人肠道细菌参考基因组有很大补充；并通过功能注释和泛基因组分析，加深了对肠道细菌功能和特点的了解。这些成果将助力人肠道宏基因组学分析和相关应用转化研究，值得专业人士仔细阅读。

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