肠道菌群功能

特应性皮炎（AD）是常见的慢性炎症性皮肤病，发病率高，不能根治。过敏原特异性免疫治疗（AIT）是唯一能改变过敏性疾病进程的治疗方法，在AD治疗中已显示出良好的效果，但个体间差异较大，其具体影响因素及机制尚不清楚。近日，中国医学科学院皮肤病医院姚煦、复旦大学附属华山医院李巍、美国约翰霍普金斯大学冷晓及团队在Cell Reports Medicine发表最新研究，从群落和个体微生物层面揭示了接受AIT的AD患者口腔菌群和肠道菌群发生显著改变，并鉴定出一种细菌，泡囊短波单胞菌与AD病情加重有关，其肠道定植可促进皮肤炎症并影响AlT的疗效，值得关注。

特应性皮炎过敏原特异性免疫治疗研究论文基础研究肠-皮肤轴

抑郁

谢鹏+周新雨：抑郁猴的大肠黏膜和肠腔菌群发生了什么变化？

此前对重度抑郁症（MDD）的肠-脑轴研究大多集中在粪便菌群，而缺乏对肠黏膜菌群和肠腔菌群的分析；而且，相关研究多数采用的是小鼠模型，而小鼠的菌群与人类有较大差异。重庆医科大学第一附属医院谢鹏、周新雨与团队，在Molecular Psychiatry发表的一项最新研究填补了这些空白。该研究通过慢性不可预知温和应激（CUMS）方法构建了MDD食蟹猴模型，用16S测序和代谢组学方法，揭示了猴子的抑郁表型与不同肠段的黏膜和肠腔菌群组成和功能的关系，为进一步揭示肠道菌群在MDD发病机理中的作用，提供了新视角。

抑郁食蟹猴肠粘膜菌群肠腔菌群肠道菌群功能

帕金森病

多组学分析帕金森病中的肠道菌群组成和功能

不少研究表明，帕金森病（PD）患者存在肠道菌群改变，但其与疾病的功能性关联尚不清楚。Annals of Neurology近期发表的一项研究，纳入了104名帕金森病（PD）患者和96名对照个体，详细分析了PD中的粪便微生物组和代谢组的改变，及其与患者临床表型的关联，揭示了PD相关菌群的代谢功能变化与PD发生发展的密切关系，表明特定的肠道菌群代谢物或可作为PD的标志物和治疗靶点。

帕金森病肠道菌群代谢组肠道菌群功能肠-脑轴

多发性硬化

多发性硬化患者的随病情进展的肠道菌群功能变化

多发性硬化（MS）的起始阶段通常为复发缓解型多发性硬化（RRMS），晚期发展为继发进展型多发性硬化（SPMS）。来自PNAS上发表的一项最新研究，对比分析了健康对照、RRMS患者与SPMS患者的粪便菌群及代谢产物的差异，发现RRMS患者的菌群丙酸盐及丁酸盐生物合成通路显著减少，而SPMS患者的菌群DNA错配修复及氧化显著增加。

多发性硬化研究论文基础研究肠道菌群代谢产物肠道菌群功能

肥胖

肥胖 ClpB 肠道菌群功能肥胖 Krista A Varady

终末期肾病

任发政+于政权等：产毒的肠道菌群，或促进肾衰竭

终末期肾病（ESRD）是慢性肾脏疾病的晚期并发症，其发生和进展与有毒代谢物的积累密切相关。动物研究表明许多尿毒症毒素来源于肠道微生物，而这些毒素通常不能通过透析有效去除。中国农业大学任发政院士和于政权教授与团队近期在Gut上发表研究，对223名ESRD患者和69名匹配的健康对照个体进行了多组学分析，揭示了患者肠道微生物组、代谢组和疾病表型组之间的密切关系，表明患者异常的肠道菌群能通过产生有害代谢产物加重临床预后，并用动物模型提供了因果性证据。这些发现提示，调节肠道菌群有望成为降低患者尿毒症毒性的靶标，应作为透析的补充疗法进行深入研究。

终末期肾病肠-肾轴肠道菌群肠道菌群功能代谢组

长寿

极长寿老人的肠道菌群有啥特点？

长寿 Microbiome metagenome extreme longevity xenobiotics

代谢疾病

Cell子刊：区分与肥胖和糖尿病相关的肠道菌群特征

Cell Host and Microbe发表的一项最新研究，在德国队列中通过对比健康瘦子与健康胖子、健康胖子与糖尿病胖子的肠道菌群，找出了与肥胖和糖尿病单独相关的菌群变化特征，发现肥胖与菌群变化显著相关，而2型糖尿病与菌群变化的关联则较弱，此外，用药和膳食补充剂也可在一定程度上解释菌群的变化。

代谢疾病肥胖 2型糖尿病肠道菌群膳食补充剂

猪肠道菌群

陈从英+黄路生：性别和雄激素影响猪肠道菌群和代谢谱

《Frontiers in Microbiology》近期发表了来自江西农业大学陈从英和黄路生团队的研究，分析了猪肠道菌群和代谢物的性别差异，表明性别和雄激素可显著影响菌群的组成和功能，并探究了与血液代谢物的关联，对于理解性别和菌群如何影响宿主代谢表型有参考意义。

猪肠道菌群代谢表型性别差异雄激素肠道菌群功能

结直肠癌

Nature子刊：跨越人群的大肠癌肠道菌群特征和诊断标志物

不少研究报道了肠道菌群与结直肠癌（CRC）之间的密切关系，但在不同队列和人群之间是否存在通用的菌群诊断标志物，仍需进一步探究。《Nature Medicine》刚刚上线的一项研究，对涉及5个国家人群的已报道的队列和意大利的2个新队列的粪便宏基因组数据集，进行了荟萃分析，鉴定出在不同人群间共通的CRC相关肠道菌群组成和功能特征，构建了含16个物种的CRC疾病预测模型，并在两个额外的队列数据中得到验证。该研究再次证实了，不同人群中的CRC菌群特征存在异质性，但综合分析多个队列获得的菌群标志物，能提高诊断准确性。这些发现对于用菌群标志物进行疾病诊断，以及研究菌群成员在CRC中的潜在作用，均有参考价值。

结直肠癌肠道菌群 Cancer genomics colorectal cancer Microbial communities

新肠道细菌

Nature：发掘未知的肠道细菌

解读肠道菌群结构存在的宿主差异有助于阐释菌群对宿主健康的具体影响。Nature近期发表研究，鉴别出了1925种潜在肠道细菌，极大地丰富了已知肠道菌群种类和功能，尤其丰富了非洲和拉美地区人群的肠道菌群信息。该研究对详细阐释肠道菌群种类和功能具有参考价值。

新肠道细菌 Bacterial genomics metagenomics Microbiome 方法学

肠道细菌参考基因组

华大基因团队：1520个人肠道单细菌参考基因组，助力菌群研究

华大基因的肖亮、贾慧珏和李俊桦与团队的重要研究，近期在Nature Biotechnology发表。该研究通过培养组学方法，从健康人粪便样本中获得1520个单菌基因组草图，对现有的人肠道细菌参考基因组有很大补充；并通过功能注释和泛基因组分析，加深了对肠道细菌功能和特点的了解。这些成果将助力人肠道宏基因组学分析和相关应用转化研究，值得专业人士仔细阅读。

肠道细菌参考基因组肠道菌群培养组学宏基因组学肠道菌群功能

炎症性肠病

Science子刊：IBD及IBS患者的肠道菌群组成及功能变化

Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，对近2000名受试者（包括355名IBD患者、412名IBS患者）的肠道菌群进行了宏基因组测序，对菌群组成及功能的异同进行了全面的剖析对比。

炎症性肠病肠易激综合征炎症性肠病肠易激综合征宏基因组测序

肠道菌群功能

上海生科院等：白蚁肠道菌群如何适应食木饮食

中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所黄勇平团队等的最新研究在ISME Journal发表，揭示了降解木质食物的白蚁肠道菌群的功能特征，发现了多种与降解植物细胞壁多糖相关的酶，值得关注。

肠道菌群功能白蚁 Jennifer L Gommerman Conglei Li

白塞病

重医附一院等：可致失明的白塞病与肠道菌群有关

Microbiome发表了重庆医科大学附属第一医院杨培增团队主导的最新研究，分析了白塞病患者和健康对照的口腔和粪便菌群，揭示了患者的肠道菌群变化，并用粪菌移植实验表明菌群变化可加剧疾病。

白塞病口腔菌群肠道菌群组成肠道菌群功能 Behcet’s disease

减肥

梅奥学报：肠道菌群可影响减肥

同样的减肥方法，为什么对有些人有效，对另一些人无效？Mayo Clinic Proceedings发表的一项最新研究表明，肠道菌群中特定细菌的丰度以及菌群代谢碳水化合物的能力，可能是影响减肥效果的重要原因。虽然仍需更大规模的试验来验证，但这些发现提示，个性化减肥应考虑菌群因素。

减肥肠道菌群功能肠道菌群组成减肥干预 Lisa Ronan

环境辐射污染

核辐射之果：切尔诺贝利田鼠的肠道菌群变化

来自ISME Journal的一项研究，分析发生过核泄漏的切尔诺贝利附近的堤岸田鼠的肠道菌群，并与附近非污染区的田鼠进行对比，表明环境辐射显著改变肠道菌群和功能，可能在动物对环境污染的适应中有重要作用。

环境辐射污染肠道菌群组成肠道菌群功能 David Andrew Mills Jinxin Liu