Bacterial genomics

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文章数：5篇

Cell：工业化加速了人肠道菌群中的基因转移

工业化影响了人类肠道生态系统，改变了微生物的组成和多样性。细菌基因组是否也能适应宿主种群的工业化，目前尚不清楚。Cell最新发表的文章，通过对工业化和非工业化地区的15个人群的肠道细菌进行分析，发现基因的水平转移（HGT）在近几代宿主的肠道菌群中积累，发生频率很高，而且工业化的生活方式与较高的HGT比率有关。即肠道细菌在适应宿主生活方式的基础上不断获得新的功能，较高速率的HGT可能与人类历史中工业化发展有关。

肠道细菌基因水平转移工业化 human gut microbiome Industrialization

益生菌安全性

Nature子刊：ICU患者吃益生菌，可能增加菌血症风险

使用益生菌在特定风险人群中可能会有健康隐患。Nature Medicine最新发表了来自美国波士顿儿童医院的研究，对该院过去5年多以来的2.2万名ICU患者进行了回顾性分析，从流行病学和细菌基因组两个方面证实，ICU患者服用含LGG的益生菌产品，会增加这种细菌相关的菌血症风险，再次提示益生菌在特定人群中的潜在安全性问题。

益生菌安全性 Bacterial genomics Translational research 重症监护患者鼠李糖乳杆菌GG

新肠道细菌

Nature：发掘未知的肠道细菌

解读肠道菌群结构存在的宿主差异有助于阐释菌群对宿主健康的具体影响。Nature近期发表研究，鉴别出了1925种潜在肠道细菌，极大地丰富了已知肠道菌群种类和功能，尤其丰富了非洲和拉美地区人群的肠道菌群信息。该研究对详细阐释肠道菌群种类和功能具有参考价值。

新肠道细菌 Bacterial genomics metagenomics Microbiome 方法学

动物共生菌群

共生细菌帮助野蜂抵抗真菌

共生菌群对野蜂的健康也可能具有重要作用。本研究发现了一种共生于野蜂体表、体内和蜂巢中的类芽孢杆菌，可能具有抑制真菌生长，维护野蜂健康的作用，对研究共生菌演化、共生菌-宿主互作具有参考价值。

动物共生菌群 16S metabarcoding American foulbrood Anti-microbial activity Bacterial genomics

细菌基因组学

Nature：大规模细菌基因功能预测

细菌基因组中，约1/3的蛋白编码基因缺少功能注释。上周Nature发表一项大规模研究，从32种细菌中，鉴定出超过一万个未知功能基因的突变表型，并通过比较序列分析，对这些基因的可能功能进行了预测。这些发现有助于推进对细菌基因功能的研究，值得专业人士关注。

细菌基因组学基因注释蛋白功能预测 Bacterial genomics Genetic techniques