蛋白功能预测

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蛋白功能预测

文章数：3篇

RefSeq和宏基因组时代的原核基因组注释流程

国家生物技术信息中心的参考序列（RefSeq）项目已包含超过31.5万个细菌和古细菌基因组和2.36亿个蛋白质，并提供最新和一致的注释。近日，美国国家卫生研究院人员在Nucleic Acids Research发表最新研究，系统描述了RefSeq集合的当前内容，特别是MAG的贡献。还解释了对选择过程所做的更改，以便在保持存储质量的同时融入MAG所代表的新颖性。最后，提出了具有专家策划功能分配的RefSeq蛋白的比例有所增长，并且基因本体论术语会使RefSeq蛋白的注释更加丰富，值得关注。

宏基因组宏基因组组装基因组（MAGs）研究论文基础研究蛋白功能预测

Cell：挖掘人体菌群中不为人知的小蛋白

受计算机和试验方法所限，小蛋白常因难以检测而研究中被忽视。Cell本期发表的一项重磅研究，通过计算机方法，对人体宏基因组中潜在的小蛋白进行了大规模分析和鉴定，揭示出菌群含有的大量未知小蛋白及其多样化的功能，对于进一步挖掘菌群功能有重要意义。

小蛋白 Microbiome small proteins bacteria Genome

细菌基因组学

Nature：大规模细菌基因功能预测

细菌基因组中，约1/3的蛋白编码基因缺少功能注释。上周Nature发表一项大规模研究，从32种细菌中，鉴定出超过一万个未知功能基因的突变表型，并通过比较序列分析，对这些基因的可能功能进行了预测。这些发现有助于推进对细菌基因功能的研究，值得专业人士关注。

细菌基因组学基因注释蛋白功能预测 Bacterial genomics Genetic techniques