Cancer genomics

搜索
登录

Cancer genomics

文章数：5篇

国内团队：绘制人类大肠癌淋巴转移图谱

淋巴转移与结直肠癌（CRC）的复发和生存率降低密切相关，肿瘤细胞如何在淋巴网络中扩散，在很大程度上是未知的。来自中国医学科学院&北京协和医学院的Haizeng Zhang和来自北京大学的白凡研究团队合作在Nature Communications发表最新研究，分析来自10位CRC患者的原发灶、淋巴结转移（LNMs）和肝转移（LMs）肿瘤样本的基因组景观，总结了CRC转移的3种不同模式，并表明肿瘤细胞在淋巴网络内的跳跃扩散是常见的。该研究揭示了CRC复杂的转移模式，具有重要的临床意义。

结直肠癌 Cancer genomics gastrointestinal cancer Metastasis 肿瘤基因组学

Cell子刊：揭秘结直肠癌耐药机理

抗EGFR抗体治疗（CET）只对部分转移性结直肠癌患者有效，尽管KRAS或NRAS突变可造成原发性耐药，但很多KRAS和NRAS野生型患者也会产生耐药，机制尚不明确。本研究揭示了部分KRAS和NRAS野生型患者耐药机制，其获得性耐药来自于肿瘤相关纤维母细胞（CAFs）对CET敏感型癌细胞的重塑，通过分泌生长因子等方式使其转化为CET耐药型癌细胞。

结直肠癌 cancer evolution eGFR drug resistance mechanisms molecular subtype

Nature子刊：跨越人群的大肠癌肠道菌群特征和诊断标志物

不少研究报道了肠道菌群与结直肠癌（CRC）之间的密切关系，但在不同队列和人群之间是否存在通用的菌群诊断标志物，仍需进一步探究。《Nature Medicine》刚刚上线的一项研究，对涉及5个国家人群的已报道的队列和意大利的2个新队列的粪便宏基因组数据集，进行了荟萃分析，鉴定出在不同人群间共通的CRC相关肠道菌群组成和功能特征，构建了含16个物种的CRC疾病预测模型，并在两个额外的队列数据中得到验证。该研究再次证实了，不同人群中的CRC菌群特征存在异质性，但综合分析多个队列获得的菌群标志物，能提高诊断准确性。这些发现对于用菌群标志物进行疾病诊断，以及研究菌群成员在CRC中的潜在作用，均有参考价值。

结直肠癌肠道菌群 Cancer genomics colorectal cancer Microbial communities

Nature子刊：11个CBS突变热点是胃肠癌潜在驱动因素

非基因编码区的突变是潜在的癌症驱动因素，Nature Communications发表来自新加坡的最新研究，分析了212个胃癌样本的全基因组，找出了34个非编码区突变热点，其中11个是CTCF结合位点（CBS）。进一步分析表明，这11个CBS突变热点可能是胃肠癌潜在的驱动因素。

胃肠癌胃癌结直肠癌非编码区突变染色体不稳定

Nature：用类器官研究大肠癌的肿瘤内异质性

类器官在癌症研究中的重要性不断凸显，本周Nature再发一篇类器官用于结直肠癌的研究。研究者培养患者肿瘤的单细胞衍生类器官，并分析这些类器官的基因突变、DNA甲基化、转录组和药物反应情况，对肿瘤内部的异质性进行研究。使用单细胞衍生的类器官可以克服单细胞层面研究中“材料不足”的困难，有广阔的研究应用前景。

类器官结直肠癌(CRC) 单细胞肿瘤内异质性 Cancer genomics