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文章数：5篇

Cell：人类微生物组研究的单细胞方法（综述）

随着人类微生物组研究的深入，新的研究方法也不断出现并普及。Cell最新发表了来自比利时鲁汶大学Jeroen Raes团队的重磅综述，详细介绍了用于研究人类微生物组的各种前沿单细胞方法，并探讨了该领域存在的挑战。文章干货很多，推荐研读原文。

单细胞人类微生物组单细胞RNA测序单细胞基因组学高通量培养组学

国内团队：基于单细胞甲基化谱的大肠癌部分甲基化域综合分析

表观遗传畸变在结直肠癌的病理生理状态中起着重要作用，DNA整体低甲基化主要发生在部分甲基化区域（PMDs），然而，PMDs在单个细胞中的分布及细胞间的异质性尚不清楚。来自哈尔滨工业大学的蒋庆华研究团队在Briefings in Bioinformatics发表最新研究，首次使用全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）和单细胞全基因组亚硫酸氢盐测序（scBS-seq）检测结直肠癌（CRC）DNA甲基化图谱。该研究检测到的PMDs具有作为表观遗传生物标志物的潜力，并为基于单细胞甲基化数据的CRC研究提供了新的视角。

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Nature子刊：新技术揭示大肠癌的单细胞核型变异演变

肿瘤进化的核心是遗传多样性的产生。然而，人类肿瘤中新生核型变异出现和传播的范围和模式尚不清楚。Nature Genetics近期发表的文章，开发出一种既能对肿瘤类器官生长过程进行活细胞成像，又能对每一个成像细胞进行全基因组测序的技术——3D Live-Seq。通过对患者来源的类器官和新鲜肿瘤活检样本进行分析，发现全基因组或局部的核型改变都是普遍存在的，而其演变的方式也具有间断和逐渐多样化两种。该技术可绘制癌症的核型多样性的时间动态性和演变模式，有助于重建肿瘤恶化的进化路径。

结直肠癌单细胞核型变异

体细胞LINE-1逆转录转座具有患者/细胞异质性

在早期胚胎、成人大脑、胃肠道和包括上皮性胃肠道肿瘤在内的许多癌症中都发现了体细胞LINE-1（L1）逆转录转座。最新发表在PNAS的研究分析了来自结肠、胰腺和胃腺癌的单细胞，以及其配对正常组织体细胞LINE-1的逆转录转座事件。该研究发现，同一类型癌症的不同患者之间，以及特定癌症的不同细胞中，体细胞的逆转录转座有显著差异。推测当细胞环境有利于逆转录转座时，非整倍体使癌细胞易于L1插入，逆转录转座或发生在从整倍体向非整倍体的过渡中。

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Nature：用类器官研究大肠癌的肿瘤内异质性

类器官在癌症研究中的重要性不断凸显，本周Nature再发一篇类器官用于结直肠癌的研究。研究者培养患者肿瘤的单细胞衍生类器官，并分析这些类器官的基因突变、DNA甲基化、转录组和药物反应情况，对肿瘤内部的异质性进行研究。使用单细胞衍生的类器官可以克服单细胞层面研究中“材料不足”的困难，有广阔的研究应用前景。

类器官结直肠癌(CRC) 单细胞肿瘤内异质性 Cancer genomics