异质性

转移性结直肠癌（CRC）与预后不良和疾病进展迅速有关。除肝转移外，腹膜癌是UICC（国际癌症控制联盟）IV期CRC患者的主要死亡原因。而对不同位点的肿瘤细胞和相应的肿瘤微环境进行解析，缺乏相应的研究。Journal of Clinical Investigation近期发表的文章，对小鼠多脏器转移性结直肠癌（CRC）不同转移位点之间的细胞异质性进行分析。

结直肠癌异质性

克罗恩病（CD）

肠道菌群与克罗恩病活动性的异质性关联

克罗恩病（CD）与特定的细菌有关联，但研究中报告的关联差异很大。这种不一致性可能是由于个体患者之间的异质性关联，导致与细菌丰度的平均值没有明显或只有微弱的关系。Gut Microbes近期发表的文章，发现特定细菌家族与CD和恶化有关，但由于病程、用药史、肠道菌群组成等异质性，患者间相关性不同。

克罗恩病（CD）肠道菌群异质性

消化性溃疡

Nature子刊：胃肠细胞分化和激素调节会影响消化性溃疡？

消化性溃疡主要指发生于胃和十二指肠的慢性溃疡，是一多发病、常见病。近日，日本东京大学研究人员在Nature Genetics发表最新研究，通过规模跨祖先荟萃分析和全基因组关联研究，发现胃肠细胞分化和激素调节在PUD病因学中至关重要，值得关注。

消化性溃疡遗传效应研究论文基础研究全基因组关联

瘤内微生物

国内团队：瘤内菌群或可预测肝癌手术预后

肝细胞癌（HCC）的不良预后与肿瘤微环境（TME）的特征密切相关。先前研究证实TME中微生物组对癌症进展的存在和潜在影响。近日，北京协和医院毛一雷、杨华瑜、南京医科大学第一附属医院孙跃明、封益飞及团队在Clinical and Translational Medicine发表最新研究，共纳入115名接受肝切除术的肝癌患者，系统地阐明了肝癌患者微生物群特征，并将肝型作为HCC术后预后预测的潜在标记物，值得关注。

瘤内微生物术后预后研究论文基础研究荧光原位杂交术

成纤维细胞

一文总结成纤维细胞在肠道发育、稳态和疾病中的作用（综述）

成纤维细胞在肠道发育，稳态和疾病中的功能在近几年引起研究者的重点关注，近期发表在Trends in Cell Biology上的一篇综述对该方面的研究进展进行了系统的总结。单细胞测序技术的兴起使得研究人员能够更加细致地探究肠道成纤维细胞的异质性，成纤维细胞不仅可以作为肠道干细胞的微环境调控其功能，更能够对调控肠道中的淋巴内皮，血液内皮和免疫细胞，其在肠道发育、稳态和疾病中能够通过不同的信号分子和其他细胞类型进行信号交流，预示肠道成纤维细胞是一个极具开发前景的，可以干预和治疗肠道疾病的靶点。

成纤维细胞异质性免疫调节 PDGFRA 肠道再生

宏基因组测序

中科院团队建立微量样本的宏基因组学研究方法

宏基因组测序大大扩展了人们对各种生态位中菌群的理解。然而，将低于1ng的DNA转换为高质量的宏基因组文库并且获得高保真数据仍然面临挑战。本研究中作者评估了多种文库制备方法在0.5 pg-5 ng合成菌群DNA上的表现，描绘了污染特征，并进一步应用不同算法去除污染。本研究证明，结合适当的文库制备方法和去污染算法，可以从低于1ng的微量DNA样本中获得高质量宏基因组数据。本研究为不同微生物载量的样本的宏基因组学研究方法提供了参考。

宏基因组测序内切酶文库制备异质性去污染算法

基于零膨胀分位数的方法

通过零膨胀分位数法 (ZINQ) 对微生物组数据进行非参数关联检验

本研究提出了 ZINQ，这是一种微生物群与二分或定量临床变量之间基于分位数的关联检验，基于一系列场景中的真实数据和对真实数据集的应用的全面模拟表明，与现有检验相比，即使它提供了更好的假阳性控制，ZINQ 通常具有相等或更高的功效，其为当前的菌群差异丰度分析提供了强大而可靠的替代方案。这项工作为菌群数据的关联检验提供了一种稳健而强大的非参数回归方法。

基于零膨胀分位数的方法 I类错误控制菌群差异丰度分析异质性

结直肠癌

国内团队：基于单细胞甲基化谱的大肠癌部分甲基化域综合分析

表观遗传畸变在结直肠癌的病理生理状态中起着重要作用，DNA整体低甲基化主要发生在部分甲基化区域（PMDs），然而，PMDs在单个细胞中的分布及细胞间的异质性尚不清楚。来自哈尔滨工业大学的蒋庆华研究团队在Briefings in Bioinformatics发表最新研究，首次使用全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）和单细胞全基因组亚硫酸氢盐测序（scBS-seq）检测结直肠癌（CRC）DNA甲基化图谱。该研究检测到的PMDs具有作为表观遗传生物标志物的潜力，并为基于单细胞甲基化数据的CRC研究提供了新的视角。

结直肠癌研究论文基础研究异质性部分甲基化域

结直肠癌

结直肠癌转移灶对治疗反应的异质性

RECIST标准指南中，病变总数通常用于评估患者对治疗的客观反应，但这种评估忽略了转移瘤对治疗响应的异质性。Cancer Research近期发表的文章，对2802例结直肠癌患者的11404个转移灶进行分析，发现转移灶之间对治疗的响应性具有异质性。而且，转移瘤对治疗反应的时空异质性决定了药物的治疗效果和患者生存率，可用于改善目前的治疗评估方法和患者预后。

结直肠癌转移灶异质性

瘤内菌群

于君团队：肿瘤内的菌群是不均一的，且与大肠癌变相关

结直肠癌（CRC）中存在肠道菌群失调，具核梭杆菌等细菌可促进CRC的发生发展。然而，肿瘤内的菌群组成和特征及其与CRC进展的关系尚不清楚。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表重要研究，首次揭示了结直肠腺瘤和CRC中的肿瘤内菌群异质性，及其与CRC进展和CRC相关基因突变的关系。这些发现为研究肠道菌群在CRC中的作用和机制提供了新的视角。

瘤内菌群结直肠癌异质性 colorectal cancer colorectal carcinogenesis

代谢相关脂肪性肝病

专家共识：NAFLD改名MAFLD

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）发病率逐渐上升，人们对疾病的认识愈加深入，其命名与诊断标准却并无更新。旧的命名由于对疾病的驱动因素及其异质性定义并不准确，间接影响了精准诊疗和药物研发。近日，国际脂肪肝专家小组就NAFLD更名为代谢相关脂肪性肝病（MAFLD）一事经投票达成共识并发表于《Gastroenterology》。这篇共识文章重点探讨了更名原因和依据，总结疾病特征并提出临床研究的创新策略，期待更名能为推动临床实践和公共卫生策略产生正面影响。

代谢相关脂肪性肝病 MAFLD nomenclature metabolic heterogeneity

液体活检

胃肠肿瘤为何耐药：液体活检，来揭秘

① Aparna Parikh 在2017年ESMO世界胃肠肿瘤大会报道，35例分子诊断的GI肿瘤患者疾病进展时常规再活检和收集循环肿瘤DNA（ctDNA），预测靶向治疗的疗效，鉴定出获得性耐药的异质性机制；② 在临床实践中，系统性进行液体活检，64%患者存在多重耐药机制，术后检测循环血ctDNA，作为最小残存病灶的标记物，亦用于化疗和免疫治疗和放疗患者；③ 液体活检简便易行，较组织活检更敏感，可辅助或替代组织活检，困难在于缺失治疗前血样采集机会。

液体活检靶向治疗循环肿瘤DNA 耐药机制异质性

粪便免疫化学检测(FIT)

大便验癌：靠不靠谱？

① 纳入6204例受试者的12项临床研究；② 粪便免疫化学检测（FIT）诊断结肠癌（CRC）的平均敏感性为93%，平均特异性为91%，阳性似然比（LR+） 10.30，阴性似然比（LR-）0.08；③ FIT诊断进展型大肠肿瘤（AN）的平均敏感性为48%，平均特异性为93%，LR+ 6.55，LR- 0.57；④ 亚组分析显示，FIT界值在15- 25-μg/g粪便之间，对CRC的诊断敏感性和特异性最佳；⑤ 个人或家族性风险超过平均值的受试者，FIT对CRC的诊断准确率高，但对AN的诊断准确率中等。

粪便免疫化学检测(FIT) 结肠癌(CRC) 敏感性特异性阳性似然比

急性髓系白血病(AML)

P53在AML中的作用

① P53是造血干细胞功能的核心，其异常影响AML的演变、生物学和治疗疗效，通常预示不良预后，在AML初治病例中，突变率不足百分之十，各种AML中更常见非突变P53异常所致的野生型（wt） P53功能障碍，影响更大；② 突变P53癌基因的功能获得，非突变wtp53失活的机制，可望具有治疗意义；③ 患者特异性TP53基因分型以及P53蛋白的功能评价，可调整合理化的、P53基础上的精准治疗；④ 阐明P53功能障碍的机制，可更好地处理目前拟用于AML的p53靶向治疗。

急性髓系白血病(AML) P53功能障碍异质性精准治疗

多发性骨髓瘤

多发性骨髓瘤：基因组学（综述）

① 多发性骨髓瘤（MM）的肿瘤细胞有非常多种的遗传改变，这篇文章综述了各种新技术带来的新认知；② 最震惊的是发现所有MM都是有亚克隆的，即使是我们认为的“驱动基因”也不一定在所有亚克隆中出现，即使是1个患者体内的MM细胞也可能有多种神奇的进化方式；③ 一些研究根据14q32异位和是否整倍体将患者分组，还没有令人信服的结果；④ 异质性：MM异质性程度很高，不能找到共有的突变；⑤ 冗余性：一条通路中多个基因发生突变。

多发性骨髓瘤基因组学二代测序亚克隆性异质性

酪氨酸激酶

促进乳腺癌免疫逃逸的“两面派”：Shc1

① 酪氨酸激酶抑制剂（TKI）提高部分适应性免疫，酪氨酸激酶组的异质性和功能冗余是免疫应答持续的障碍；② Shc1 （ShcA）通路同时激活乳腺癌细胞内STAT3免疫抑制信号，破坏STAT1驱动的免疫监视，Y239/Y240-ShcA磷酸化受损，选择性降低STAT3活性，促进对免疫检查点抑制剂和肿瘤疫苗的敏感性；③ TK信号的缺失启动STAT1驱动的免疫监视，代偿性STAT3过度活化可克服；④ 抑制pY239/240-ShcA依赖性STAT3信号，增强乳腺癌对多种免疫治疗的敏感性。

酪氨酸激酶免疫微环境异质性功能冗余 Shc1 (ShcA)支架

胶质母细胞瘤(GBM)

胶质母细胞瘤的时空异质性：52例病人的127处标本，多组学分析

① 对52例胶质母细胞瘤（GBM）患者的127个多部位或纵向的切片标本进行基因组和表达特征分析；② 组织块和单细胞数据，同一肿瘤组织块的样本，具有相似的遗传学和表达特征，多灶性肿瘤和/或长期复发肿瘤来源于不同的克隆；③ 患者来源胶质瘤细胞（PDCs）的化学筛选提示疗效与遗传学相似性相关，多灶性肿瘤富含PIK3CA突变、药物应答模式不同；④ 靶向主干事件较靶向个性事件更有效减少肿瘤负荷；⑤ 多部位活检的整合基因组分析，促进GBM患者的靶向治疗。

胶质母细胞瘤(GBM) 精准医学异质性基因组化学筛选

3D器官成像技术

酷炫：肿瘤相关巨噬细胞3D成像！

① 肿瘤进展过程中免疫系统的参与，是肿瘤研究的最前沿；② 在小鼠肺癌模型中，采用组织光透明技术以及注射肿瘤相关巨噬细胞（TAM）靶向荧光纳米颗粒（NP），可进行快速肿瘤体积分析，获得在全肺内细胞水平上TAM浸润的空间信息；③ TAM的密度，在相同动物上，不同肿瘤之间，具有异质性，独立的肺肿瘤模型中，TAM总密度不同，纳米药物输送与TAM异质性相关；④ 提高TAM在全部肿瘤和肿瘤内的穿透力，可改善集落刺激因子1受体（CSF-1R）阻断剂的疗效。

3D器官成像技术肿瘤相关巨噬细胞(TAM) 纳米颗粒(NP) 异质性集落刺激因子1受体(CSF-1R)

荟萃分析

接受蒽环、赫赛汀治疗的“胖子”心脏毒性更大？别急着下结论！

① Guenancia等荟萃分析了，肥胖或超重与蒽环类和蒽环类序贯曲妥珠单抗治疗乳腺癌的心血管毒性之间的相关性；② 该文纳入随机效应分析和网络荟萃分析（NMA），但荟萃分析和NMA的方法学有待商榷；③ 纳入15个现况研究、病例对照研究、队列研究，以获取汇总的比值比；④ 纳入不同样本量的研究（如一个研究纳入52例，另一研究纳入3073例），可能导致荟萃分析结果中小样本研究的影响偏倚，应根据研究设计进行亚组分析；⑤ 该研究的结果应谨慎解读。

荟萃分析网络荟萃分析(NMA) 随机效应分析相似性假设异质性