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二代测序
文章数:4篇
APOBEC3A/B基因突变
震惊:BRCA突变还和鼻咽癌有关!
① 对来自希腊和罗马尼亚的局部晚期鼻咽癌(NPC)患者的126例肿瘤标本进行大规模测序,其中89%EBV阳性;② 最常见的突变是BRCA1(54%), BRCA2(29%), TP53(22%), KRAS(18%),59例(48%)存在BRCA1 p.Q563,且罗马尼亚患者中更常见,NPC具有APOBEC3A / B和核苷酸切除修复相关突变特征,但未发现病原来源的种系突变;③ 富于肿瘤细胞和富于淋巴细胞的样本相比,后者个体化的突变更多,共享的突变更少;④ EBV阳性和BRCA1突变可能影响NPC患者的预后。
APOBEC3A/B基因突变
BRCA1基因突变
BRCA2基因突变
鼻咽癌
二代测序
弥漫性大B细胞淋巴瘤
弥漫大B细胞淋巴瘤:多组学研究
① 对106个基因进行靶向二代测序,对150例DLBCL检测基因组拷贝数改变(CNA),在111例患者的独立队列中验证临床意义;② 生发中心B细胞DLBCL和活化B细胞DLBCL的突变特征、病理通路改变和CAN不同;③ NOTCH通路基因和抑癌基因(TP53/CDKN2A)的突变,而非个别基因,是不良预后因素,并在独立验证队列中得到确认;④ 生物信息学药物发现分析识别出69例(46%)患者至少携带一种基因组改变,这些可能成为药物疗效的潜在靶点。
弥漫性大B细胞淋巴瘤
突变
预后
NOTCH 通路
基因组改变
肿瘤免疫治疗
太可怕:小部分肿瘤患者使用PD-1抗体,病情反而加速进展
① 免疫检查点抑制剂的抗肿瘤作用在很多研究中都已经被证实,其对肿瘤远期预后的作用也得到了认可;② 然而,在部分接受免疫治疗患者中出现了治疗后病情急速进展、恶化的现象;③ 本研究共纳入155名接受免疫治疗(CTLA-4,PD-1/PD-L1,其它临床实验药物)的患者,并对其肿瘤组织进行二代测序;④ 6名有MDM2/MDM4基因扩增的患者出现免疫治疗后病情急速进展的情况,10名EGFR突变的患者中有2名出现了病情急剧恶化的现象,相关的分子机制尚不明确。
肿瘤免疫治疗
加速生长
不良事件
二代测序
Jennie Haw
多发性骨髓瘤
多发性骨髓瘤:基因组学(综述)
① 多发性骨髓瘤(MM)的肿瘤细胞有非常多种的遗传改变,这篇文章综述了各种新技术带来的新认知;② 最震惊的是发现所有MM都是有亚克隆的,即使是我们认为的“驱动基因”也不一定在所有亚克隆中出现,即使是1个患者体内的MM细胞也可能有多种神奇的进化方式;③ 一些研究根据14q32异位和是否整倍体将患者分组,还没有令人信服的结果;④ 异质性:MM异质性程度很高,不能找到共有的突变;⑤ 冗余性:一条通路中多个基因发生突变。
多发性骨髓瘤
基因组学
二代测序
亚克隆性
异质性