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突变
文章数:10篇
进化依赖
有些宿主为何对微生物群进化成瘾?(观点)
进化成瘾有时也被称为进化依赖,它可能发生在任何宿主系统中,从人类肠道到植物根系,再到寄生其他微生物的微生物。近日,加州大学欧文分校研究人员在Trends in Microbiology发表最新观点,在某些情况下,微生物实际上可能并没有帮助它们的宿主;相反,没有微生物的宿主可能会因为对微生物上瘾而出现功能障碍。在这种情况下,宿主依赖微生物来发挥功能,但微生物实际上并没有提供任何益处作为回报。
进化依赖
微生物
观点
基础研究
共生
多基因组合检测
临床多基因检测或可识别早发性CRC患者种系致病变异的差异
早发性结直肠癌(EOCRC)负担因种族/族裔群体而异,但种系遗传易感性在EOCRC差异中的作用仍未明确。近日,美国范德比尔特大学研究人员在Journal of Clinical Oncology发表最新研究,纳入3980名EOCRC患者,在485名个体中鉴定出530个生殖细胞致病性或可能致病性变异。通过临床多基因组合测试,在CRC易感基因的种系变异中发现了新的种族和民族差异,特别是在德系和西班牙裔个体中,值得关注。
多基因组合检测
突变
研究论文
基础研究
种族差异
结直肠肿瘤
一文读懂大肠癌进化模式的最新见解(综述)
癌变仍然主要是一个进化过程,在这个过程中,基因组和表观遗传变化是先天获得的,其有助于在肿瘤微环境中选择有利的细胞表型以增加细胞适应度。发表在Gastroenterology上的一篇review以结直肠癌(CRC)为模型回顾了肿瘤测序对肿瘤进化的一些见解。表明CRCs对于驱动突变通常是细胞克隆存在,尽管它们对于拷贝数变化可能是异质的,但肿瘤在该阶段的进化可能是中性的,没有或非常弱的选择。另外,即使在选择确实起作用的地方,它也并不总是具有优势,而且可能被后天形成的基因组不稳定性所影响,这种不稳定性可以导致主驱动基因中微弱优势的体细胞突变以相对较高的频率产生。了解这些肿瘤进化模式对治疗CRCs以及理解其发展具有重要意义。
结直肠肿瘤
前景展望
突变
结肠癌(CRC)
肿瘤进化
结直肠癌
Nature子刊:大肠癌持久性细胞种群动态和突变率特征
研究证据表明,癌症持久性细胞是靶向治疗长期疗效的主要限制。然而,癌症持久性细胞的表型和种群动态仍不清楚。最新发表在Nature Genetics的研究结合实验表征和数学建模,建立了一个定量框架来研究持久性细胞。该研究提示了癌症治疗可能会影响癌细胞的持久性和突变性,并将精确抑制容易出错的DNA聚合酶作为一种限制肿瘤复发的策略。
结直肠癌
研究论文
基础研究
持久性细胞
耐药
结直肠癌
Lancet子刊:深度学习框架预测大肠癌分子路径和关键突变
确定大肠癌中分子通路和关键突变的状态对最佳治疗决策至关重要。最新发表在Lancet Digital Health的研究,经过大规模验证,提出用于预测临床重要突变和分子通路的算法(如微卫星不稳定性),可在结直肠癌中对患者分层,进行靶向治疗。相比基于测序或基于免疫组化的方法,该方法可能成本更低,周转时间更快。
结直肠癌
研究论文
医学研究
基础研究
深度学习
结直肠癌
Nature子刊:促癌大肠杆菌产生的colibactin引起结直肠癌热点突变
粘膜上皮是慢性细菌感染和伴随毒素损伤的常见目标,大多数癌症起源于该组织。Nature Medicine近期发表的文章,揭示出大肠杆菌次生代谢产物colibactin导致的DNA双链断裂或是结直肠癌热点突变的来源,为大肠杆菌在癌症的病因作用提供证据。感兴趣的读者可以结合此前Nature发表的一篇同样结论的论文对照阅读(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1078683050)。
结直肠癌
大肠杆菌
colibactin
DNA双链断裂
突变
胃肠道间质瘤
发现新型胃肠道间质瘤抑制剂
胃肠道间质瘤(GIST)是最常见的人类肉瘤,由KIT或血小板源性生长因子α(PDGFRα)突变驱动。一至三线的抑制剂(伊马替尼、舒尼替尼、瑞戈非尼)虽带来GIST的治疗革命,但各有其缺点,目前仍需要开发对KIT/PDGFRα突变具有显著抑制作用且耐药性良好的药物。最新发表在Science Translational Medicine的研究发现一个对KIT/PDGFRα突变抑制性良好的抑制剂AZD3229。AZD3229可克服伊马替尼和舒尼替尼的耐药缺点,且对血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)活性没有影响。AZD3229有潜力成为抑制KIT/PDGFRα突变的一流抑制剂。
胃肠道间质瘤
抑制剂
KIT/PDGFRα
AZD3229
突变
菌群内互作
肠道固有菌群抑制病原菌生长、定植及抗生素耐药性进化
复杂微生物群落中微生物间的相互作用可能通过资源竞争抑制某种细菌的生长和抗生素抗性进化,但也可能通过抗性基因的水平转移加速抗性进化。此外,细菌通过接合亦可获得抗生素耐药性。目前尚不清楚二者之间是如何平衡的。发表在《PLoS Biology》上的一项研究表明,肠道固有微生物可抑制病原菌生长,并抑制接合作用介导的水平基因转移和削弱因染色体突变而获得抗性的突变体的适应性,从而抑制抗性进化。
菌群内互作
水平基因转移
突变
抗性质粒
适应性突变
弥漫性大B细胞淋巴瘤
弥漫大B细胞淋巴瘤:多组学研究
① 对106个基因进行靶向二代测序,对150例DLBCL检测基因组拷贝数改变(CNA),在111例患者的独立队列中验证临床意义;② 生发中心B细胞DLBCL和活化B细胞DLBCL的突变特征、病理通路改变和CAN不同;③ NOTCH通路基因和抑癌基因(TP53/CDKN2A)的突变,而非个别基因,是不良预后因素,并在独立验证队列中得到确认;④ 生物信息学药物发现分析识别出69例(46%)患者至少携带一种基因组改变,这些可能成为药物疗效的潜在靶点。
弥漫性大B细胞淋巴瘤
突变
预后
NOTCH 通路
基因组改变
突变
儿童肿瘤的靶点和新药:美国国家癌症研究所临床试验
① 细胞毒性化疗的剂量强化已经不能在儿童恶性肿瘤结局方面取得进展,靶向治疗策略是现今的机遇;② 儿童肿瘤协作组(COG)与NCI合作COG-NCI儿科治疗选择的分子分析(儿科MATCH)方案,集中的基础设施,分析生物标志物、进行靶向治疗试验;③ 患有复发性或难治性实体瘤、淋巴瘤或细胞增生症的儿童可入组;④ 儿科MATCH靶向和药物优先级(TAP)委员会经综合评估推荐了7种药物-靶向对,本文对这些靶向药物的可及性、有效性和安全性进行综述。
突变
癌症
生物标志物
儿童
2期临床试验