生物标志物

① MasSpec Pen工具，可控制和自动传送离散水滴至组织表面，有效地萃取生物分子，体外分析20例患者肿瘤组织薄切片，253例患者的乳腺、肺、甲状腺和卵巢的正常和肿瘤组织样本；② 获取包括代谢产物、脂质和蛋白质在内的潜在肿瘤生物标志物分子图谱；③ 预测肿瘤的敏感性96.4%，特异性96.2%，总体准确率96.3%，预测甲状腺良性和恶性肿瘤以及肺癌的不同组织学类型；④ 可准确诊断混合组织成分的肿瘤边界，适于术中肿瘤诊断，而无明显的组织损伤。

质谱分析系统肿瘤诊断手术切缘生物标志物 Kristine A Kuhn

精准肿瘤学

个体化临床决策：到底要怎么做！

① 制备头颈部鳞癌患者来源原代培养（PDCs）的可筛选文库，可重复性地预测配对的患者来源异种移植瘤模型的治疗疗效；② PDCs可指导临床实践，在两个n=1的协同临床研究中预测肿瘤进展，这些模型来源的PDCs的全面整合“组学”揭示YAP1为约24%口腔鳞癌患者的疗效和生存期的有效生物标志物；③ 预期根据推荐的PDC方法，可揭示治疗分层的生物标志物，指导将来实时治疗决策；④ 患者来源模型的疗效可作为临床疗效的生物标志物。

精准肿瘤学患者来源原代培养患者来源异种移植瘤头颈部鳞癌生物标志物

临床研究

肿瘤免疫治疗临床试验：如何设计合适的研究终点

① 免疫靶向治疗疗效不遵循线性剂量-效应和剂量-毒性动力学，生物标志物驱动的替代性研究终点可更好地获得作用机制、I-O药物的生物学反应，可前瞻性纳入早期I-O临床研究；② 总体生存期为评估I-O药物在后期临床研究的疗效的金标准，新的替代性终点如客观缓解率和里程碑式的生存期，患者报告的结果，有助于重新定义I-O临床研究的终点，驱动有更效的药物研发；③ 以最小的剂量和时间计划获得生物学疗效，后期临床研究应聚焦于真实世界的疗效。

临床研究研究终点总体生存期剂量-效应剂量-毒性

晚期去势耐受前列腺癌（mCRPC）

CTC指导去势抵抗型前列腺癌的治疗决策

① 对179例组织学确诊的接受ARSI或紫杉醇治疗的mCRPC的9225份循环肿瘤细胞（CTCs）进行定量分析数字化病理特征；② 采用香农指数在个体肿瘤样本细胞类型多样性的基础上定量异质性，二线或后线治疗前收集145列样本，判断与总体生存期（OS）的相关性；③ CTC表型异质性低的人群，抗雄激素受体信号传导抑制剂（ARSI）治疗OS改善，异质性高的人群，紫杉醇治疗OS更佳；④ 定量CTC表型异质性有助于选择ARSI 或紫杉醇治疗mCRPC患者。

晚期去势耐受前列腺癌（mCRPC）循环肿瘤细胞（CTCs）总体生存期（OS）抗雄激素受体信号传导抑制剂（ARSI）紫杉醇

癌症

癌症静脉血栓途径生物标志物 Jian Chen

肝细胞癌

HBV前基因组RNA分类与肝癌分型

① 分析99例HBsAg阳性、病毒抑制的手术或肝移植的HCC（T）和非肿瘤肝脏（NT）样本，检测总HBV DNA和RNA以及作为HBV活动性复制标志物的cccDNA和pgRNA；② 在NT中未见HCC感染的HBV基因型，HCC组织内存在病毒的慢性复制；肿瘤内检出cccDNA和pgRNA，则不存在肿瘤微血管浸润，预后佳；③ pgRNA阳性HCC的特征为细胞周期和DNA修复标志物水平低，表达HBV受体NTCP，肿瘤分化良好；④ 来源于非整合的完整HBV基因组的pgRNA是病毒复制和预后的敏感标志物。

肝细胞癌乙型肝炎病毒共价闭环DNA（cccDNA）前基因组RNA（pgRNA）生物标志物

雄激素受体剪切异构体7(AR-V7)

外泌体来源的AR-V7：预测前列腺癌激素治疗敏感性

① 雄激素受体剪切异构体7（AR-V7）与去势抵抗前列腺癌（CRPC）激素治疗耐药性相关；② 数字液滴聚合酶链反应（ddPCR）法可检测血浆来源外泌体RNA的AR-V7；③ 二线激素治疗前收集36例 CRPC患者血浆，26例患者接受阿比特龙治疗，10例接受enzalutamide治疗；39%患者AR-V7（+）；④ AR-V7阴性组中位无进展生存期明显长于AR-V7（+）患者，基线AR-V7（+）患者的总体生存期明显短于阴性患者；⑤ 血浆来源外泌体RNA是AR-V7的可靠来源，可预测激素治疗耐药性。

雄激素受体剪切异构体7(AR-V7) 去势抵抗前列腺癌 (CRPC) 数字液滴聚合酶链反应(ddPCR) 外泌体激素治疗

线粒体

来自线粒体的标记物：预测乳腺癌预后和内分泌治疗耐药

① 145例初治ER+、淋巴结转移、管状A型BC患者，接受他莫西芬治疗；② 鉴定出60余个线粒体生物标志物，预测治疗失败和复发；③ 组合的线粒体基因特征（CMGS）1包括4个线粒体蛋白（HSPD1、UQCRB、MRPL15和COX17），CMGS 2 包括两个蛋白（HSPD1和VDAC2），均可有效预测复发和远处转移，在3180例大型BC群体中仍可有效预测；④ 线粒体生物标志物可提供新的伴随诊断平台，线粒体生物合成应作为新的治疗靶点以克服肿瘤复发、远处转移和治疗失败。

线粒体线粒体生物合成生物标志物治疗失败复发

急性粒细胞白血病

白血病靶点研究新利器：超级增强子分析

① 分析66例急性粒细胞白血病（AML）患者的增强子图谱，鉴定出6个新的亚型及其相关调控位点，在维甲酸受体α（RARA）基因位点存在强超级增强子（SE）的亚群；② RARA SE及伴随的高水平RARA mRNA使细胞株及体内模型对RARα选择性抑制剂SY-1425（他米巴罗汀）非常敏感；③ SY-1425仅对高水平RARA mRNA的AML患者来源异种移植瘤（PDX）模型有效，且与全反式维甲酸处理的APL疗效相似，其特征为诱导已知的维甲酸应答基因、促进分化、抑制增殖。

急性粒细胞白血病维甲酸受体α 强超级增强子生物标志物

抗氧化剂

内源性DNA加合物与肝癌防治

① γ-OHPdG是由脂质过氧化衍生的内源性诱变DNA加合物；② 肝脏DNA中的γ-OHPdG水平年龄依赖性增加，在所有三种动物模型中与肝细胞癌（HCC）相关；③ Theaphenon E治疗显著降低Xpa（-/-）小鼠肝脏中的γ-OHPdG水平，并显著降低了这些小鼠的HCC发病率，从对照组的100%降低到14%，也有效抑制DEN注射小鼠中HCC的发展；④ 使用两组患者的临床样本，较高水平的γ-OHPdG分别与低生存期和低无复发生存期显著相关。

抗氧化剂生物标志物癌症预防肝细胞癌（HCC） Antioxidant

非小细胞肺癌（NSCLC）

早期非鳞非小细胞肺癌：免疫预后指标

① 随着筛查的进行，早期非小细胞肺癌（NSCLC）的发病率增加，需要可靠的预后性生物标志物以鉴定复发风险高的患者进行辅助治疗；② 2414例非鳞NSCLC的样本，采用训练数据集建构含40个基因的25个基因对的预后性免疫特征；③ 免疫特征可显著将I、IA、IB或II期患者按总体生存期分为高和低风险组，校正临床和病理因素后，仍是独立的预后因素；④ 临床和免疫特征结合提高预后的准确性，需行前瞻性研究以检测其在非鳞NSCLC个体化治疗中的作用。

非小细胞肺癌（NSCLC）生物标志物免疫特征总体生存期(OS)

RAS野生型转移性结直肠癌（mCRC）

FDA批准帕尼单抗用于RAS野生型转移性结直肠癌一线治疗

① FDA已经批准帕尼单抗（Vectibix）联合FOLFOX方案，用于治疗RAS野生型转移性结直肠癌（mCRC）一线患者；② 扩大RAS指示是基于总生存率（OS）的改善，在第三阶段主要研究回顾性生物标志物分析，未经治疗的患者总生存率提高5.6个月；③ 帕尼单抗研究表明mCRC患者的整体存活率改善且没有Ras基因突变；④ 这一批准强化了生物标志物检测的意义作为mCRC的规划治疗工具，进一步验证了精密药改善患者疗效的潜力。

RAS野生型转移性结直肠癌（mCRC）帕尼单抗（Vectibix）生物标志物 Maria G Pachiadaki Ramunas Stepanauskas

免疫检查点阻断

肿瘤免疫治疗疗效评价和标志物研发

① 采用免疫检查点阻断（ICB）的肿瘤免疫治疗改变了晚期肿瘤的治疗范式，靶向CTLA-4、PD-1和PD-L1的单抗的疗效显著，获得批准用于治疗多种恶性肿瘤；② 肿瘤起效方式不同于传统模式，需要开发新的特异性免疫治疗疗效评价标准，在研的有irRC、irRECIST和iRECIST标准；③ 评估PD-L1及其他免疫检查点分子、肿瘤浸润淋巴细胞、IFNγ、突变负荷、新抗原等可预测ICB的疗效的生物标志物，多学科综合建立有效的生物标志物，以推进精准免疫治疗。

免疫检查点阻断肿瘤免疫治疗生物标志物

雄激素受体V7（ARV7）

DNA修复缺陷的前列腺癌：接受CTLA-4抗体+PD-1抗体，有效率高

① 15例ARV7+循环肿瘤细胞的mCRPC患者接受IPI / Nivo治疗（二期临床研究）；② PSA50=7%，ORR=25%，durable PFS=20%，PSA-PFS=3.0个月，rPFS=3.9个月，OS=9.5个月，DNA修复缺陷的肿瘤患者治疗效果更好；③ 相关AE（3-4级）占46%（包括2例肝炎，2例结肠炎，1例肺炎），无治疗相关死亡；④ ARV7 +前列腺癌患者的DNA修复基因突变比例较高；⑤ IPI / Nivo治疗具有较好的安全性，且疗效令人鼓舞，特别是针对DNA修复缺陷的肿瘤。

雄激素受体V7（ARV7）转移性前列腺癌（mCRPC）抗肿瘤生物标志物 DNA修复缺陷

二代测序（NGS）

1万例肿瘤患者基因测序：都发现了啥！

① 10945例晚期肿瘤患者，有临床和病理参数，肿瘤和配对正常组织标本，采用全面的杂交捕获基础上的二代测序方法MSK-IMPACT，建立一个大规模的前瞻性临床测序计划；② 鉴定出有临床意义的体细胞突变、激酶融合与重排、新的非编码改变、常见和少见肿瘤之间共享的突变信号、体细胞超突变；③ 11%患者参与遗传学匹配的临床研究，但需要系统性研究分析肿瘤基因组学对患者预后的长期作用；④ 为发现新的生物标志物和深化研究，所有结果可公开访问。

二代测序（NGS）生物标志物体细胞突变 Hailong Cao Kui Jiang

乳腺癌

ER阳性乳腺癌的新辅助治疗：重磅综述

① 新辅助治疗的临床研究为乳腺癌的药物研发提供了优良的方法，尤其是三阴性和HER2过表达亚型，病理完全缓解是长期获益的替代指标；② 综述新辅助内分泌治疗ER（+）/HER2阴性乳腺癌的临床获益、药物研发中的应用及限制、辅助治疗和晚期患者临床研究的优势、生物标志物研发；③ 新辅助内分泌治疗是新药研发的良好平台、促发新药联合、生物标志物验证、药物耐药机制的发现；④ 综述重点是如何将预测性生物标志物最优化地整合进新型临床研究设计中。

乳腺癌新辅助治疗内分泌治疗生物标志物耐药机制

NOTCH信号

小细胞肺癌发展过程中的两面派：Notch

① 小细胞肺癌（SCLC）中Notch基因功能缺失及Notch激活抑制，表明Notch信号抑制肿瘤；② 内源性Notch激活，使10–50%肿瘤细胞神经内分泌性向非神经内分泌性转换，此转换由转录抑制因子Rest（也称Nrsf）调节；③ 研究表明，SCLC中Notch信号既可抑制肿瘤，又是原致癌基因；④ 临床前模型中，Notch信号阻断结合化疗抑制肿瘤生长和延迟复发；⑤ Notch信号激活生成肿瘤细胞，可能作为SCLC患者应用Notch通路抑制结合化疗的生物标志物。

NOTCH信号小细胞肺癌神经内分泌原致癌基因生物标志物

突变

儿童肿瘤的靶点和新药：美国国家癌症研究所临床试验

① 细胞毒性化疗的剂量强化已经不能在儿童恶性肿瘤结局方面取得进展，靶向治疗策略是现今的机遇；② 儿童肿瘤协作组（COG）与NCI合作COG-NCI儿科治疗选择的分子分析（儿科MATCH）方案，集中的基础设施，分析生物标志物、进行靶向治疗试验；③ 患有复发性或难治性实体瘤、淋巴瘤或细胞增生症的儿童可入组；④ 儿科MATCH靶向和药物优先级（TAP）委员会经综合评估推荐了7种药物-靶向对，本文对这些靶向药物的可及性、有效性和安全性进行综述。

突变癌症生物标志物儿童 2期临床试验

弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)

弥漫大B细胞淋巴预后分型“新武器”：MYC/BCL-2基因分型

① 研究对象：R-CHOP方案治疗的347例初治的弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）；② 研究方法：二代测序（NGS）、高通量SNP阵列分析、Lymph2Cx数字基因表达谱；③ 结果：MYC/BCL2的遗传学改变发生率及临床意义主要取决于细胞起源（COO）亚型；④ 在ABC型DLBCL中，BCL2扩增者预后差；在GCB型DLBCL中，BCL2转位者预后差；⑤ 联合BCL2的遗传学改变与国际预后指数，可判断COO亚型预后；⑥ COO亚型特异性生物标志物可用于DLBCL患者免疫治疗的风险分层。

弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL) 二代测序(NGS) 高通量SNP阵列分析 Lymph2Cx数字基因表达谱细胞起源(COO)

肿瘤相关微粒(taMPs)

这项技术神了：不穿刺也能鉴别肝硬化和肝癌

① 本研究纳入172例肝脏恶性肿瘤（肝细胞癌（HCC）、胆管癌（CCA）），54例单纯肝硬化，202例对照；② HCC和CCA中膜联蛋白 V（+）EpCAM（+）（AE+）CD147（+）肿瘤相关微粒（taMPs）上升，AE（+）ASGPR1（+）CD133（+） taMPs可区别肝癌与单纯肝硬化；③ AE（+）ASGPR1（+） taMPs的诊断率高，是HCC和CCA液体活检的新型生物标志物，可无创地评估晚期肝癌；④ 微粒（MPs）的表面成分与亲代相似，分离血液中MPs，筛选表面成分，可检出并区分肝癌和慢性肝硬化。

肿瘤相关微粒(taMPs) 细胞外大囊泡肝细胞癌(HCC) 胆管癌(CCA) 肝硬化

蛋白质组学

血液蛋白质组学：寻找最合适的肿瘤标志物

① 肿瘤早期诊断的概念，助推了精准诊断，肿瘤的早期诊断可让患者获益更多；② 亲和蛋白质组学可准确测量血清中的诊断信息，这些可操作的信息可用以指导肿瘤的精准和循证医学治疗（预测性标志物）以及精准预测预后（预后性标志物）；③ 从单一标志物的应用转变为多个含可评估信息的标志物的联合应用，称之为识别特征，可大幅提高诊断的准确率；④ 本文综述了血液蛋白质组学（液体活检），阐述了蛋白质生物标志物识别特征的临床应用。

蛋白质组学识别特征液体活检精准诊断生物信息