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二代测序(NGS)
文章数:5篇
骨髓增生异常综合征(MDS)
E2H2突变的MDS/MPN有这样的分子生物学特点
① 靶向深度NGS分析41例EZH2突变的骨髓增生异常/骨髓增生性肿瘤患者的遗传表征;② 靶向NGS发现共有190个个体突变的复杂突变模式,EZH2突变与TET2,RUNX1和ASXL1突变高频共存;③ 克隆实验表明EZH2突变是白血病发生的早期事件,并显示出复杂的突变等级;④ EZH2野生型和突变型患者有许多表达不同的基因,一些基因作为EZH2的靶点,在细胞系与患者之间表现出相反的单向调节;⑤ 一些基因,如CXXC5、ETS1和VAV3之前表明在白血病发生中发挥作用。
骨髓增生异常综合征(MDS)
骨髓增生性肿瘤
EZH2突变
白血病
二代测序(NGS)
菌群
卵巢癌和菌群:脑洞大开的研究
① 微生物制剂在人类和其他哺乳动物的定殖,代表着一种独特的菌群方式,菌群的生态失调,与病理相关,包括肿瘤;② 采用泛病原体阵列(PathoChip)联合捕获-二代测序,筛选卵巢癌样本,以及配对的和非配对的样本,鉴定出卵巢癌独特的菌群识别标志;③ 卵巢癌病例中存在着具有显著意义的病毒、细菌、真菌和寄生虫识别标志不同的群,肿瘤样本中宿主基因组内特定病毒整合位点,可能参与肿瘤形成;④ 卵巢癌菌群识别标志有助于靶向治疗的研发。
菌群
二代测序(NGS)
泛病原体阵列(PathoChip)
卵巢癌
基因组
弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)
弥漫大B细胞淋巴预后分型“新武器”:MYC/BCL-2基因分型
① 研究对象:R-CHOP方案治疗的347例初治的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL);② 研究方法:二代测序(NGS)、高通量SNP阵列分析、Lymph2Cx数字基因表达谱;③ 结果:MYC/BCL2的遗传学改变发生率及临床意义主要取决于细胞起源(COO)亚型;④ 在ABC型DLBCL中,BCL2扩增者预后差;在GCB型DLBCL中,BCL2转位者预后差;⑤ 联合BCL2的遗传学改变与国际预后指数, 可判断COO亚型预后;⑥ COO亚型特异性生物标志物可用于DLBCL患者免疫治疗的风险分层。
弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)
二代测序(NGS)
高通量SNP阵列分析
Lymph2Cx数字基因表达谱
细胞起源(COO)
乳腺癌
病人来源的移植瘤模型(PDX)用于乳腺癌:何去何从?
① 乳腺癌患者的经历与临床前模型之间缺乏联系,二代测序和患者来源异种移植瘤(PDX)有望克服;② 比较原发灶、脑转移灶和PDX,PDX的突变情况更接近于脑转移灶,PDX捕获到大多数转移亚克隆;③ 不同组织学亚型之间移植成功率不同,导管内注射技术有望解决,特异性突变与药物疗效表型之间关系复杂;④ 今后需提高PDX研究的严谨性,包括根据原发灶基因组审查每一个PDX,匹配患者和对应PDX的药物敏感性,蛋白基因组学,将每个PDX模型纳入数据库。
乳腺癌
患者来源异种移植瘤
二代测序(NGS)
基因突变
蛋白基因组学
转移性去势抵抗前列腺癌(mCRPC)
BRCA2突变的前列腺癌:PARP抑制剂安全有效。
① 在原发性和转移性去势抵抗前列腺癌(mCRPC)中开展二代测序(NGS)研究,鉴定出DNA修复基因胚系和体细胞缺陷的发生率高于预期,尤其是BRCA2基因;② 晚期mCRPC患者中鉴定出的胚系突变和体细胞缺陷,与PARP抑制剂 (PARPi) olaparib和卡铂的疗效相关;③ 在前列腺切除标本中鉴定出纯合性和杂合性13q12缺失区域,确认BRCA2体细胞双等位基因(纯合性),无BRCA2 胚系异常;④ 多线治疗后,PARPi veliparib治疗后获得明显的影像学和生化学疗效。
转移性去势抵抗前列腺癌(mCRPC)
二代测序(NGS)
BRCA2基因
胚系突变
体细胞缺陷