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基因组
文章数:6篇
乳腺癌
乳腺癌复发转移的分子生物学“真相”
① 170例局部复发或晚期BC的299例样本,进行全基因组测序或365个基因面板测序;② 播种转移或复发的克隆种子细胞来自原发灶,保持多数驱动基因,但持续获得突变;③ 大多数远处转移获得的驱动性突变并不见于原发灶,包括SWI-SNF和JAK2-STAT3通路的失活突变;④ 诊断时原发灶的基因组代理播散性细胞的基因组,支持基因组测序用于决策原发性乳腺癌的辅助治疗,转移灶的活检和测序有助于部分患者,局部复发的测序可区分真正的复发和第二原发癌。
乳腺癌
基因组
转移
复发
体细胞突变
乳腺癌
COMT是BRCA突变患者的“保护性突变”?
① BRCA1/2 突变是乳腺癌(BC)遗传风险因子;② 3914人筛出15人BRCA1/2 突变携带者, 有5人编码儿茶酚-O-甲基转移酶的COMT单排变异p.L203,25位BRCA1/2阳性BC患者却没有;③ COMT是灭活儿茶酚雌激素的关键组分,曾研究它的突变p.V158M在BC遗传中作用;本研究却突出了另一种同义COMT变体;④ 研究虽然缺乏年龄、种族等信息,但展示了一种发现自然产生保护基因特征的新策略,这一策略适用于其他遗传疾病,并可通过增加人口基因组数据来实现。
乳腺癌
COMT变异
BRCA1/2 变异
基因组
外显率
循环肿瘤DNA(ctDNA)
循环肿瘤DNA监测:晚期肺腺癌得力助手
① 88例NSCLC患者参与血液ctDNA基因组变化与治疗结果关系研究;② 72例ctDNA≥1,主要ctDNA突变基因:TP53(44.3%患者)、EGFR (27.3%)、MET (14.8%)、KRAS (13.6%)、ALK (6.8%);③ 匹配≥1 ctDNA检测结果,25例患者接受治疗,22例受评估的患者中16例患者SD期≥6个月或PR;④ 经ctDNA检测的5例EGFR T790M突变患者接受第三代EGFR抑制剂治疗,所有患者SD期≥6个月或PR;⑤ 结合ctDNA突变分析进行治疗,具可观的治疗效果,为未来临床效用提供依据。
循环肿瘤DNA(ctDNA)
非小细胞肺腺癌(NSCLC)
基因组
基因突变
肿瘤
黑色素瘤
恶性黑色素瘤BRAF突变亚型分析:精准分析、逐个靶向
① 黑色素瘤基因组多样性限制传统和靶向治疗,疗效不能持久,ERK1/2信号传导通路的病理性激活,是肿瘤发生的关键机制;② 整合多基因组化疗和遗传学筛选,黑色素瘤基因组复发性建构变量,患者预后数据,鉴定出BRAF(V600) 黑色素瘤的2个机制亚型,具有新的肿瘤细胞生物学和提供新的治疗机会;③ 采用定量5因素遗传学生物标志可预测亚型;④ 该生物标志物可鉴定出对MEK抑制剂有效的人群,以及对目前靶向治疗无效的TBK1/IKBKE抑制剂敏感的疾病。
黑色素瘤
基因组
ERK1/2信号
TBK1/IKBKE抑制剂
菌群
卵巢癌和菌群:脑洞大开的研究
① 微生物制剂在人类和其他哺乳动物的定殖,代表着一种独特的菌群方式,菌群的生态失调,与病理相关,包括肿瘤;② 采用泛病原体阵列(PathoChip)联合捕获-二代测序,筛选卵巢癌样本,以及配对的和非配对的样本,鉴定出卵巢癌独特的菌群识别标志;③ 卵巢癌病例中存在着具有显著意义的病毒、细菌、真菌和寄生虫识别标志不同的群,肿瘤样本中宿主基因组内特定病毒整合位点,可能参与肿瘤形成;④ 卵巢癌菌群识别标志有助于靶向治疗的研发。
菌群
二代测序(NGS)
泛病原体阵列(PathoChip)
卵巢癌
基因组
胶质母细胞瘤(GBM)
胶质母细胞瘤的时空异质性:52例病人的127处标本,多组学分析
① 对52例胶质母细胞瘤(GBM)患者的127个多部位或纵向的切片标本进行基因组和表达特征分析;② 组织块和单细胞数据,同一肿瘤组织块的样本,具有相似的遗传学和表达特征,多灶性肿瘤和/或长期复发肿瘤来源于不同的克隆;③ 患者来源胶质瘤细胞(PDCs)的化学筛选提示疗效与遗传学相似性相关,多灶性肿瘤富含PIK3CA突变、药物应答模式不同;④ 靶向主干事件较靶向个性事件更有效减少肿瘤负荷;⑤ 多部位活检的整合基因组分析,促进GBM患者的靶向治疗。
胶质母细胞瘤(GBM)
精准医学
异质性
基因组
化学筛选