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生物标志物

Nature子刊：或可预测健康状态的肠道菌群健康指数

用肠道菌群作为标志物进行疾病检测，是菌群转化研究的热点之一。Nature Communications发表一项来自美国梅奥诊所的新研究，基于对4000多个人粪便宏基因组的整合分析和数学建模，构建了一个可用于独立预测健康状态的肠道菌群健康指数。这项研究进一步拓展了人们对于“健康的肠道菌群”的认知，或有转化应用潜力。

生物标志物 Biomarkers Genome informatics Microbiome 粪便宏基因组

肠道细菌参考基因组

Nature：难培养的肠道细菌基因组有“话”要说

肠道中大部分微生物难以被培养。《Nature》近期发表研究，从人群粪便宏基因组中组装出60664个原核生物基因组草图，新发现了2058个菌种水平的新OTUs，并发现新OTUs与许多疾病存在相关性。该结果大大增加了已知肠道细菌种类，对于菌群分析相关各领域都有极大意义。

肠道细菌参考基因组 environmental microbiology Genome informatics 宏基因组学难培养细菌

肝硬化患者肠道菌群的变化

① 通过对比98名肝硬化患者和83名健康对照的肠道菌群构建肝硬化患者肠道菌群基因集，包含269万个基因，其中36.1%为首次发现；② 75245个基因在患者和健康对照的丰度不同，可分为66个代表细菌物种簇，在患者和健康组的富集分别为28和38个；③ 约54%肝硬化患者富集的菌种来自于口腔，暗示肝硬化患者口腔菌侵入到肠道的特征；④ 根据15个基因标记物定义了肝硬化“病人鉴别指数”，可以较高准确性区分肝硬化患者（AUC=0.918和0.838）。

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