粪便宏基因组

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粪便宏基因组

文章数：8篇

不良心血管代谢中，肥胖驱动微生物组功能差异

肥胖（OB）常伴有不良的心血管代谢健康状况（CHS），包括血压和血糖升高、胰岛素抵抗、甘油三酯或胆固醇浓度异常等，这些都增加了心脏病、中风和2型糖尿病等相关疾病的风险。OB和CHS是合并症，经常被混淆。发表于Gut Microbes上的研究，旨在解析OB和不良CHS之间微生物组功能特征的关联，并测试它们的普遍性。结果表明，无论CHS状态如何，OB都是微生物组功能变化的主要驱动因素。

肥胖心血管代谢健康状况研究论文基础研究肠道菌群

北京协和医学院：肠菌相关血液代谢物或可检测大肠癌和腺瘤

北京协和医学院的崔巍团队在Gut发表文章，通过对结直肠癌（CRC）和腺瘤病人的血清代谢物和粪便宏基因组进行整合分析，发现CRC病人的肠道菌群发生改变，且与血清代谢物的变化具有相关性，肠道微生物相关血清代谢物（GMSM）可有效区分CRC、腺瘤病人和健康对照。同时研究利用GMSM构建模型可准确区分CRC、腺瘤病人和健康对照，具有临床应用的潜力。

结直肠癌血清代谢物粪便宏基因组

生物标志物

Nature子刊：或可预测健康状态的肠道菌群健康指数

用肠道菌群作为标志物进行疾病检测，是菌群转化研究的热点之一。Nature Communications发表一项来自美国梅奥诊所的新研究，基于对4000多个人粪便宏基因组的整合分析和数学建模，构建了一个可用于独立预测健康状态的肠道菌群健康指数。这项研究进一步拓展了人们对于“健康的肠道菌群”的认知，或有转化应用潜力。

生物标志物 Biomarkers Genome informatics Microbiome 粪便宏基因组

细菌适应性

Cell子刊：人体肠道内的“适者生存”

任何环境下细菌都在经历自然选择过程。来自MIT的赵诗杰博士与其同事近期在《Cell Host and Microbe》发表研究，将菌株培养技术与粪便菌群宏基因组测序技术联用，发现了脆弱拟杆菌通过积累突变来适应人体宿主环境的模式、人体肠道适应性密切相关的基因以及在人体宿主内的菌株演化动态特点。该结果有助于研究肠道共生细菌的适应性机制，对于阐释细菌-人体宿主互作以及共演化具有重要参考价值。

细菌适应性宿主内演化粪便宏基因组菌株培养脆弱拟杆菌

Nature子刊：跨越人群的大肠癌肠道菌群特征和诊断标志物

不少研究报道了肠道菌群与结直肠癌（CRC）之间的密切关系，但在不同队列和人群之间是否存在通用的菌群诊断标志物，仍需进一步探究。《Nature Medicine》刚刚上线的一项研究，对涉及5个国家人群的已报道的队列和意大利的2个新队列的粪便宏基因组数据集，进行了荟萃分析，鉴定出在不同人群间共通的CRC相关肠道菌群组成和功能特征，构建了含16个物种的CRC疾病预测模型，并在两个额外的队列数据中得到验证。该研究再次证实了，不同人群中的CRC菌群特征存在异质性，但综合分析多个队列获得的菌群标志物，能提高诊断准确性。这些发现对于用菌群标志物进行疾病诊断，以及研究菌群成员在CRC中的潜在作用，均有参考价值。

结直肠癌肠道菌群 Cancer genomics colorectal cancer Microbial communities

旅行者腹泻

多组学方法探究旅行者腹泻的病因

通过23名患者和7名健康人的粪便微生物组比较研究，进一步探究了旅行者腹泻的可能病因。

旅行者腹泻 Dark matter Escherichia Coli Strain-level TM7

婴儿肠道菌群

Nature子刊：婴儿饮食和母体因素如何影响婴儿肠道菌群

Nature及其旗下子刊近期格外关注婴儿肠道菌群的研究。Nature Medicine刚刚上线的研究对60名婴儿的早期肠道菌群进行纵向宏基因组学分析，鉴定出与母乳、奶粉、大豆奶粉、母体孕期体重增长、分娩方式和抗生素施用等因素相关的婴儿肠道菌群组成和功能特征，有些发现值得深入研究。

婴儿肠道菌群粪便宏基因组母乳喂养配方奶粉大豆奶粉

肝脂肪变性

Nature子刊：肠道菌群及其代谢物引发脂肪肝

Nature Medicine刚刚上线一项多国合作研究，在非糖尿病肥胖女性脂肪肝患者中，综合分析粪便宏基因组、分子表型组和临床表型，并通过粪菌移植实验，明确了肠道菌群及其功能在脂肪肝中的作用，并鉴定出菌群的关键代谢物苯乙酸（PAA），或可用于脂肪肝的早期检测。这些研究为粪菌移植等基于菌群的疗法治疗脂肪肝打下基础。

肝脂肪变性粪便宏基因组分子表型组代谢组转录组