细菌适应性

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细菌适应性

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细菌适应性

Science：“饥饿”下的生存策略——有益肠菌的适应之道（观点）

肠道细菌的生长、定植和适应性，受饮食和宿主的因素影响，包括缺乏营养的禁食期。研究有益肠道细菌在肠道中的适应性机制，将有助于设计具有理想特性的工程益生菌。Science最新发表的这篇观点文章，以多形拟杆菌为例，探讨了有益肠菌如何在宿主禁食时，应对缺乏营养的肠道环境。这些可为开发对肠道适应性更好的益生菌提供线索，也为禁食的健康益处提供了潜在的解释视角。

细菌适应性肠道菌群禁食

宿主-微生物稳态

Cell子刊：人鼻腔中的潜在益生菌

科学研究表明，在正常人体中栖息着千亿个以上的微生物，种类多达400多种，主要分布于消化道、眼、鼻、口腔、皮肤及阴道中。尽管在人类肠道、口腔、阴道和皮肤发现了包括益生菌在内的数量众多的细菌，但对于上呼吸道的有益细菌还知之甚少。发表在Cell Reports上的一项研究从健康人体鼻腔中分离到了若干乳杆菌菌株，包括干酪乳杆菌（L.casei）、植物乳杆菌（L.plantarum）、清酒乳杆菌（L. sakei）、鼠李糖乳杆菌（L.rhamnosus）等。其中干酪乳杆菌AMBR2在鼻腔内具有较强的适应性，并具有抗菌活性和免疫调节作用，表明该菌株具有作为上呼吸道益生菌的巨大潜力。

宿主-微生物稳态 upper respiratory tract niche-adaptation Microbiome probiotics

吲哚对肠道细菌的双相趋化作用

菌群在肠道内的空间分布，受到细菌对肠内代谢物的趋化性的影响。PNAS近期发表的一项研究表明，大肠杆菌对肠道内的代谢物吲哚的趋化反应是双相的，可能影响了细菌在肠道内的空间分布。

趋化性吲哚 adaptation chemoreceptors flagella

可移动遗传元件

Cell子刊：用MGEfinder分析细菌中的可移动遗传元件

细菌的演化主要通过DNA突变和可移动遗传元件（MGE）的转移，《Cell Host and Microbe》发表的这项研究介绍了一个用于分析MGE的生信工具MGEfinder，并用其分析了9种细菌病原体，为MGE如何影响抗生素耐药性、毒力和致病性提供了新见解。

可移动遗传元件 Mobile genetic elements transposable elements bacteria Pathogen

Nature子刊：肠道拟杆菌的共同调节基因参与分解复杂聚糖

聚糖是人类结肠微生物的主要碳源。《Nature Microbiology》近期发表研究，发现以多形拟杆菌为代表的肠道共生拟杆菌含有复杂的碳水化合物活性酶体系，可以利用肠道中复杂N-聚糖等多聚糖。该研究对阐释肠道菌群适应性具有重要参考价值。

菌群代谢聚糖糖代谢肠道拟杆菌细菌适应性 Iain Templeman

细菌适应性

Cell子刊：人体肠道内的“适者生存”

任何环境下细菌都在经历自然选择过程。来自MIT的赵诗杰博士与其同事近期在《Cell Host and Microbe》发表研究，将菌株培养技术与粪便菌群宏基因组测序技术联用，发现了脆弱拟杆菌通过积累突变来适应人体宿主环境的模式、人体肠道适应性密切相关的基因以及在人体宿主内的菌株演化动态特点。该结果有助于研究肠道共生细菌的适应性机制，对于阐释细菌-人体宿主互作以及共演化具有重要参考价值。

细菌适应性宿主内演化粪便宏基因组菌株培养脆弱拟杆菌

肠杆菌对营养匮乏条件具有高适应性

细菌会进化出一系列应对环境压力的特点。《PNAS》近期发表研究，发现用营养匮乏条件筛选口腔菌群后，肠杆菌科的潜在治病菌株获得生长优势，基因组合转录组均发生适应性变化。该研究对于解释肠杆菌科的环境持留性、适应性具有重要价值。

口腔细菌细菌适应性 Oral microbiome microbial ecology Klebsiella

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Science：肠内生存不易，倒位子或是细菌适应肠道环境的利器

细菌如何适应变化的环境？Science发表的最新研究表明，一种称为倒位子（inverton）的遗传元件可能在肠道菌适应肠内环境中有重要作用。含有启动子的倒位子可翻转方向，使其调控的基因表达状态在“开”和“关”之间切换，从而在需要的时候让细菌表达有利于其生存的基因，比如与细菌表面结构分子和抗生素耐药性有关的基因，前者有助于细菌-环境（比如宿主免疫）互作，后者能帮细菌抵御抗生素的毁灭性打击，从而使细菌更好的在肠道等宿主环境中安居。

细菌适应性倒位子启动子细菌-宿主互作抗生素耐药基因