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Molecular ecology
文章数:2篇
病毒组
“可爱”背后:企鹅可能也是重要病毒库
有观点认为企鹅等南极动物面临的病原体暴露压力较低,导致其在其它环境中的疾病易感性增强。《ISME Journal》上发表的一项最新研究,对3种南极企鹅的体内及体表寄生虱的RNA病毒组进行了测序分析,发现企鹅携带的RNA病毒多样性与其它区域(如澳大利亚)的水鸟类似,提示企鹅也是重要的病毒储存库。
病毒组
community ecology
microbial ecology
Molecular ecology
Phylogenetics
微生物分类
Nature子刊:高通量&无偏差,分析微生物群落的新方法
小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因,如细菌中的16S和真核生物的18S,是微生物的分子“身份证”,常用于微生物多样性和分类等研究。传统方法难以避免扩增引物偏倚性对结果的影响,而对SSU rRNA进行全长测序可以消除这种局限性,更准确的鉴定微生物。本期Nature Biotechnology[IF:41.667]发表的研究,通过巧妙的设计,用高通量方法获得高质量的SSU rRNA全长序列而无需特异引物。该方法或可在未来的菌群研究中得到广泛应用,强烈推荐。
微生物分类
小亚基核糖体RNA
引物偏差
高通量
Classification and taxonomy