高通量

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高通量

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Nature子刊：一种高通量、低成本的微生物活性测定方法

菌落形成单位测定是微生物实验室中计数活细胞的金标准。然而，使用CFU法测量既耗时又耗费资源，同时还会产生大量的塑料废物。近日，科罗拉多州立大学研究人员在Nature Microbiology发表最新研究，开发一种几何活力测定活细胞数量的方法，CFU测量超过6个数量级，同时减少10倍以上的时间和所需的耗材。GVA计算样品的活细胞计数的基础上，利用枪头进行菌落生长的分布测定。GVA与革兰氏阳性和革兰氏阴性浮游细菌、生物膜和真菌兼容。GVA可简化繁琐的CFU实验，值得关注。

活菌计数几何活力测定研究论文基础研究菌落生长

宏蛋白质组学

高通量的粪便宏蛋白质组学方法，助力大规模临床研究

mSystems上发表的一项研究，报道了一种高通量的粪便蛋白质组分析流程——SHT-Pro，具有可定量、可重复、高效率等优点，或能助力粪便蛋白质组学在大规模临床研究中的应用。

宏蛋白质组学 Diet fermented fiber high-throughput

微生物分类

Nature子刊：高通量&无偏差，分析微生物群落的新方法

小亚基核糖体RNA（SSU rRNA）基因，如细菌中的16S和真核生物的18S，是微生物的分子“身份证”，常用于微生物多样性和分类等研究。传统方法难以避免扩增引物偏倚性对结果的影响，而对SSU rRNA进行全长测序可以消除这种局限性，更准确的鉴定微生物。本期Nature Biotechnology[IF：41.667]发表的研究，通过巧妙的设计，用高通量方法获得高质量的SSU rRNA全长序列而无需特异引物。该方法或可在未来的菌群研究中得到广泛应用，强烈推荐。

微生物分类小亚基核糖体RNA 引物偏差高通量 Classification and taxonomy

新一代测序技术

高通量测序技术及其在微生物学研究中的应用

①综述阐述了Illumina公司HiSeq 2000, ABI公司SOLID和Roche公司454为代表的高通量测序技术；②着重讨论了新一代测序技术在微生物领域中的应用，包括细菌分类学，比较基因组学和演化基因组学，转录组学，宏基因组学，单细胞测序等。

新一代测序技术高通量微生物学基因组学 Janet H Iwasa