定量分析

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文章数：5篇

人体组织中真核DNA病毒组有何特征？

通过高通量测序已经揭示了许多感染真核或原核细胞的病毒类型。然而，健康人病毒群的大多数测序数据来源于生物体液（如粪便、呼吸道分泌物、尿液、唾液、粘膜等），它们只提供了居住在组织内的病毒种群的片段景观。近日，芬兰赫尔辛基大学研究人员在Nucleic Acids Research发表最新研究，纳入31名去世的芬兰人，采集了人体9个部位组织样本，进行DNA病毒富集并测序，将人类病毒群的特征从单个身体部位扩展到多个个体的多器官分析。揭示了DNA病毒群在人体器官中前所未有的普遍存在，并为疾病相关性的调查提供了基本依据，值得关注。

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Science：房刚等开发宏表观组方法定量分析真核生物DNA 6mA和细菌污染的影响

论文对DNA N6-甲基脱氧腺苷 (6mA)这一重要生物学问题持续探究，报道了使用“宏表观组”新方法，定量分析真核生物DNA 6mA并评估细菌污染的影响。DNA 6mA最近被报道在真核生物中普遍存在，它为研究生物学和疾病的研究创造了一个新的维度。然而，一些研究强调了混淆因素，真核生物中关于6mA的争论也很活跃。作者描述了一种定量 6mA 去卷积的方法，并报告说细菌污染解释了昆虫和植物 DNA 样本中的绝大多数 6mA，该方法还没有发现人类体内高 6mA 水平的证据，这项工作提倡重新评估真核生物中的 6mA，并提供了一种可行的方法。

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多组学研究

GB：一文读懂菌群多组学分析（必读综述）

这是Genome Biology[IF：11.908]发表的关于如何通过整合多组学数据对菌群进行研究分析的必读综述，这是很有指导意义的方法学干货集合，值得专业人士细读精读。

多组学研究分子流行病学定量分析 Lee-Ching Lew Heping Zhang

Nature子刊：人类对地球微生物组有何影响？

关于微生物在全球范围内因人类的活动而发生变化的潜在轨迹的一篇评论文章，值得看看。

人类地球微生物组定量分析 Derrick M Chu Kjersti M Aagaard

宏蛋白组学

Microbiome：新的宏蛋白质组学定量定性分析工具

相比于宏基因组学研究，宏蛋白组学研究能更好解读肠道菌群的生物活性，那么有什么靠谱的分析工具呢？本文推荐一读。

宏蛋白组学肠道菌群定性定量分析 Shahla Abdollahi-Roodsaz