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Nico Jehmlich
文章数:4篇
菌群相关小蛋白
新型菌群相关小蛋白的挖掘
少于100个氨基酸的小蛋白具有广泛的重要功能,但其基因组注释尚不明确,在微生物个体和群落中的结构功能更是尚未可知。Microbiome最新发表的文章对其进行了阐述。
菌群相关小蛋白
简化人类肠道菌群(SIHUMIx)
研究论文
人类宏基因组
整理的7万个人类宏基因组样本的元数据
HumanMetagenomeDB的主要目标是简化对感兴趣的公共人类元基因组的识别和使用,其集中并标准化了SRA和MG-RAST数据库中存在的人类宏基因组的元数据。它涵盖了超过69 822个与人类相关的宏基因组和203个属性。该新颖的数据库具有友好的用户界面,允许用户探索、选择和下载经过整理的元数据,从而帮助来自不同领域的科学家根据自己的兴趣选择样本。该数据库的可用性为统一的人类宏基因组数据库奠定了基础,为新的元数据和本体的协调提供了简单的指导。总之,该数据库改进了人类宏基因组的元数据本体的协调性,并简化了不同研究之间的简单查询,解释和对基础数据的简单访问。HumanMetagenomeDB可在https://webapp.ufz.de/hmgdb/上公开获得。
人类宏基因组
标准化
数据库
数据检索
元数据
微生物生态学
Nature子刊:鉴定能减少致病菌定植的肠道共生菌
包括艰难梭菌在内的很多肠道致病菌,能用肠道黏液中的糖作为养料来生长。因此,使用占据同样生态位(利用黏蛋白单糖)的共生菌去挤占致病菌的生存空间,是潜在的微生态治疗策略。Nature Communications发表的一项最新研究报道了一种方法,在小鼠中鉴定出能利用黏蛋白单糖的多种共生菌,并从中挑选构建了混合菌株群落,能有效抑制艰难梭菌的生长和定植。该研究中使用的一些思路和方法,或能为研发新型益生菌/活菌疗法提供参考。
微生物生态学
定植抵抗
艰难梭菌
益生菌
减肥手术
减肥手术对肠道菌群的独立影响
减肥手术可治疗严重肥胖并维持减重效果,但在减重效果之外,减肥手术对肠道菌群组成及功能的独立影响尚未明确。来自Microbiome上发表的一项最新研究,对比分析了通过胃旁路术减重的大鼠及通过饮食干预减重的大鼠,在肠道菌群的组成及功能上的差异。
减肥手术
胃旁路术
Longyuan Zhou
Liguo Zhu
Shixian Hu