Uri Gophna

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Uri Gophna

文章数：4篇

抗生素耐药性

抗生素治疗增加结肠袋炎患者肠道菌群的抗生素耐药性

结肠袋炎患者通常接受抗生素治疗，部分患者可能出现复发、抗生素依赖或需要更长或更多疗程的抗生素治疗。来自Gastroenterology上发表的一项最新前瞻性队列研究结果，发现多数结肠袋炎患者可对4周的抗生素治疗产生应答，但大多数会在短期内复发，而这可能是抗生素治疗导致的耐药细菌富集引起的。因此，短期交替使用抗生素、基于菌群及营养的干预手段等应被考虑用于治疗结肠袋炎。

抗生素耐药性 IBD UC Resistome metagenome

微生物生态学

Nature子刊：群居蝙蝠毛皮菌群的“同步化”

Nature Ecology & Evolution近期发表一项研究，对来自圈养和野生群落的果蝠进行纵向取样，分析肠道和毛皮菌群随时间的变化，发现果蝠的毛皮菌群组成在群落水平趋于一致，而肠道菌群的时间动态变化则有很强的个体特点。

微生物生态学果蝠毛皮菌群 Kristin A Hogquist Roland Ruscher

Cell子刊：想瘦下来？你的颤螺菌给力么？

① 颤螺菌属在肠道菌群中处于重要地位，但目前无法分离培养以至于缺乏参考基因组，其分类属于厚壁菌门下的梭菌属IV簇；② 颤螺菌属与人低体质指数（瘦）相关，且其可利用宿主糖原作为能量来源；③ 在炎症病人体内，颤螺菌属丰度显著降低，由颤螺菌属与体质指数和炎症反应的负相关性推测其可能产丁酸盐；④ 颤螺菌属可在高胆汁酸条件下生长并抵抗艰难梭菌感染；⑤ 鉴于颤螺菌属与健康之间的重要关系，未来该菌株应优先培养并测定遗传和功能特性。

颤螺菌属肠道菌群

微生物培养基

Nature子刊：微生物培养的福音——直接用16S rDNA序列来预测其培养基配方的网站

目前环境中的微生物绝大多数（90%~99%）是不可培养的，因我们对不同微生物培养条件(尤其是培养基配方)的不了解，阻碍了微生物的分离培养。随着高通量测序技术的发展，目前有大量文章是在做基于16S rDNA的微生物非培养方式研究群落多样性，但拿不到菌种使得目标微生物的应用和机理研究成为空中楼阁。有了本文中的KOMODO(Known Media Database)网站就可以有依据的预测目标微生物的培养基配方了。因此可将基于16S rDNA的微生物多样性数据与目标菌株的分离培养有机衔接起来，大大加速从生态研究到微生物资源挖掘的进程。

微生物培养基 KOMODO 数据库 16S rDNA序列生长因子