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数据库
文章数:3篇
肠道菌群
能不能利用现有数据研究肠道菌群?
① 组学研究(宏基因组、转录组、蛋白组以及影像等)带来了大量的研究数据;但是由于年代、技术、特定方法以及样本的不同,菌群数据库很难共享;② 菌群数据库现有:MG-RAST、Qiita及全球天然产物社会分子网;云存储平台有NIH cloud Commons,Illumina BaseSpace和Figshare;③ 数据的复杂性、多样性及不够标准化是共享的主要障碍;④ 除了公众认可最小报道数据标准外,鼓励/激励数据共享、对生命科学领域人员进行生物信息学培训等是可行办法。
肠道菌群
组学研究
数据库
数据共享
数据再利用
数据库
茶叶生物活性物质功效数据库
① 该数据库以300篇已发表文章为依据,在497个茶叶生物活性物质和206种疾病(表征)之间共建立了1338种关联。② 每个入口都包含了关联的三方面信息:化合物信息、疾病(表征)信息以及证据和参考文献。③ 基于这种关联,一种双向关联网络被重新建立,使用者还可以进行次级网格视图以及拓扑分析。④ 该数据库可以进行浏览、搜索和下载;提供上传页面,以及一些有用工具:如BLAST,分子对接。⑤ 数据库网址http://camellia.ahau.edu.cn/TBC2health
数据库
茶
disease
health benefit
network
茶
茶叶研究必备:小分子化合物数据库
① 茶在世界范围内广受欢迎,已发现多酚、嘌呤、生物碱、萜类等在内的数千种成分。② 相关研究从上世纪50年代起一直是热点,但尚未有相关成果的数据管理库,缺少统一的整理和该领域的成果查询。③ TMDB(茶代谢组学数据库)收集了过去的工作成果并整理,连接互联网集成数据库,可供用户通过名称、配方、CAS号等检索化合物,查看其结构分子式等基本信息以及核磁、质谱等检测结果和相关用途。④ TMDB有望成为茶叶生化和健康研究的综合资料库。
茶
数据库