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代谢组学数据

Nature子刊：如何恰当地再利用代谢组学数据（评论）

过去20年里，随着代谢组学实验数量呈现指数级增长，数据共享库对扩大该领域的影响变得至关重要。但是由于该领域仍缺乏标准化的实验和计算方法，使数据重用变得更复杂。近日，研究人员在Nature Cell Biology发表最新评论，围绕代谢数据从代谢数据质控、优先分析、代谢物注释、以及借助新的生信工具和计算软件重新处理原始数据等角度给出系统的建议，值得关注。

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能不能利用现有数据研究肠道菌群？

① 组学研究（宏基因组、转录组、蛋白组以及影像等）带来了大量的研究数据；但是由于年代、技术、特定方法以及样本的不同，菌群数据库很难共享；② 菌群数据库现有：MG-RAST、Qiita及全球天然产物社会分子网；云存储平台有NIH cloud Commons，Illumina BaseSpace和Figshare；③ 数据的复杂性、多样性及不够标准化是共享的主要障碍；④ 除了公众认可最小报道数据标准外，鼓励/激励数据共享、对生命科学领域人员进行生物信息学培训等是可行办法。

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