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Martin Steinegger
文章数:2篇
宏基因组组装
蛋白水平组装可从宏基因组样本中获取数倍蛋白序列
常规的测序数据组装都是基于DNA序列的。如果先把测序数据按6个读码框翻译成蛋白质,然后再根据氨基酸序列组装,则称为蛋白水平组装。Plass就是完成此任务的一个软件。我们可以看到,作为一个新事物,蛋白水平组装具有一些优势和劣势。
宏基因组组装
宏基因组
基因组组装
土壤宏基因组
海洋宏基因组
序列聚类
Nature子刊:用于宏基因组蛋白质序列聚类分析的新工具
Nature Communications近期发表的一篇文章,介绍了一个新的序列聚类软件Linclust,适合用于宏基因组中大量蛋白质序列的聚类分析。
序列聚类
宏基因组算法
Gad Frankel
Caroline Mullineaux- Sanders