代谢建模

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代谢建模

文章数：3篇

研究菌群代谢功能的新模型

Gut Microbes近期发表研究，提出了一种新的模型来研究菌群的代谢功能，并用其分析了梭杆菌属细菌在肠癌中的代谢作用。

代谢建模肠道菌群

微生物互作

Nature子刊：菌群内种间互作依赖于不造成代谢压力的分泌物

微生物间通过交换代谢产物进行互作，但这些代谢产物往往会为微生物带来代谢压力。本研究通过计算机建模模拟不同条件下微生物的生长和代谢，发现微生物利用代谢压力较小的分泌物进行种间信息交流，维持微生物生态系统稳定。该成果对研究菌群建立以及菌株互作具有参考价值。

微生物互作低消耗代谢产物种间互作代谢建模微生物生态系统

生物信息学工具

VMH——整合人体和肠道菌群的代谢数据库

Nucleic Acids Research近期发表文章，报道了一个新的跨学科数据库——人类虚拟代谢数据库VMH。该数据库涵盖了人体和肠道微生物的代谢信息，并将其与疾病和营养联系起来，可用于饮食、代谢与疾病的大规模、多组学研究。

生物信息学工具代谢建模数据库 Eran Elinav Patrick Veiga