Katherine R Amato

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Katherine R Amato

文章数：9篇

人类和非人灵长类动物肠道中，丁酸盐产生途径基因丰度相似

在人类进化的过程中，肉食和烹饪等饮食习惯的改变导致了纤维摄入量的减少，而纤维消耗减少与肠道降解纤维的微生物类群的减少有关，特别是丁酸盐产生菌。因此，人类的饮食变化可能会影响丁酸盐产生有关的微生物基因的丰度。Molecular Biology and Evolution发表的研究，通过检索公开数据库中的基因信息，分析了四种主要的丁酸生成途径一碳水化合物降解途径(乙酰辅酶a)，以及三种氨基酸降解途径(4-氨基丁酸、戊二酸和赖氨酸)在人类和非人类灵长类中及工业化和非工业化人群中的丰度。结果发现，与大多数非人灵长类动物相比，人类具有更高丰度的丁酸产生途径。此外，研究发现工业化人群和非工业化人群的丁酸盐生产途径存在差异。本结果或对饮食、肠道微生物群和人类健康之间的相互作用研究具有重要意义。

丁酸肠道微生物组人类进化代谢

菌群-环境-健康

肠道菌群或是环境和健康之间的桥梁

在种族、性别认同和差异、社会经济地位低的弱势人群中，许多疾病的患病率更高。由环境带来的这种健康不平等现象值得探究。肠道菌群受宿主环境影响，并且具有个体/群体差异，或许是造成健康不平等的原因之一。在PNAS上发表的这篇文章，深入分析了环境-肠道菌群-健康三者之间的两两“依附"作用，并指出从生态角度调控肠道菌群改善健康不平等现象的可能性。该角度/观点值得相关人士参考。

菌群-环境-健康

肠道微生物组

Nature Reviews：肠道微生物组的宿主特异性（综述）

Nature Reviews Microbiology近期发表的综述文章，总结了有助于系统共生的微生物群落组装模式。就整个微生物群而言，系统共生不那么普遍，因为微生物组在整个动物界分类丰富。有趣的是，哺乳动物似乎是这种模式的一个例外。尽管在分类学上有丰富的微生物群落，哺乳动物通常表现出系统共生，这一例外或是哺乳动物性状独特组合的结果，这种组合加强了多个个体群落组装过程的影响。

肠道微生物组宿主特异性

野生狮尾狒的肠道菌群季节性变化

肠道菌群组成的适应性变化是野生动物适应食物季节性变化的方式之一。来自Microbiome上发表的一项最新研究，分析了野生狮尾狒（一种非人灵长类动物）的肠道菌群季节性变化，发现降雨及温度分别通过影响食物供应及体温调节，影响狮尾狒的肠道菌群组成及功能。该研究结果提示，肠道菌群的可塑性为宿主提供了对食物及温度等环境变化的适应性。

动物菌群狮尾狒研究论文基础研究其它动物

新冠大流行对人类共生微生物的影响（观点）

新冠病毒的全球大流行为人类的生活方式带来了极大的改变。这些生活方式的改变和认知将在很大程度上对人类共生微生物发生长期的、巨大的影响，从而对人类健康带来巨大的影响。近期一篇发表在PNAS的展望，从新冠肺炎本身以及对于人类生活方式的影响等多个角度和层面讨论了新冠病毒流行对于人类共生菌，特别是肠道菌群的影响，以期未来当人类面对新的流行疫情时，充分考虑多个角度的影响，选择更加适合的防控策略和手段。

新冠疫情卫生假说共生菌群其他展望

宿主-菌群互作

宿主生理和饮食，哪个对菌群影响更大？

ISME Journal发表的一项研究，从演化角度，分析比较了18种灵长目动物的肠道菌群组成，表明影响菌群的主要因素是宿主本身的生理演化，而非宿主食性。该结论与此前的部分研究有所不同，作者也进行了一些探讨。对菌群-宿主互作、菌群-宿主共演化感兴趣的专业人士不妨关注。

宿主-菌群互作灵长类动物微生物组食性

BMCB：人体微生物组的进化（综述）

这是Rob Knight等人在BMC Biology[IF：6.779]发表的重要综述，系统性地总结了人类对自身和微生物组的进化过程的相关研究，横向对比了人类与其他灵长类动物、不同的脊椎动物之间的微生物的差别，提出了人类微生物组进化的可能进程。对关注进化和基因组学的人来说，这篇文章值得好好看看。

进化 Codiversification evolution Habitat filtering Microbiome

肠道微生物组

人类微生物组群的系统发育观点

① 生活在肠道中的数以万亿计的肠道微生物在人类生物学和疾病中起着重要的作用。虽然已经人类已经做了很多工作来探索其多样性，但对微生物群体的充分理解需要一个渐进的过程。② 本综述中，我们将人类群体的微生物群体置于与人类近亲和远缘两种动物亲属的微生物背景下进行了比较。③ 我们讨论了产生宿主特异性微生物组态的潜在机制以及破坏这些机制的后果。④ 我们认为这种更广泛的系统发育观点有助于对理解人类-微生物组群的相互作用机制。

肠道微生物组特异性微生物系统发育 Codiversification evolution

Environmental conditions

JMM：野外研究菌群，储存时间及保存方法影响大

在野外收集样本研究菌群，哪些因素会对实验结果有影响呢？这篇文章IF不高，但很值得大家看看，特别推荐下。

Environmental conditions Fecal microbial community Fecal preservation Gut microbiota Primates