数据处理

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文章数：3篇

对肠道菌群研究中的饮食变量进行量化

如何将饮食差异进行量化，并作为可控变量运用于肠道菌群研究具有重要意义。本文比较了三套饮食指标与菌群差异的相关性，并发现健康饮食指标（HEI）与菌群的多样性变化的关联性最好，适合用于肠道菌群分析。该研究成果对于肠道菌群分析、饮食变量控制都极富参考价值，值得专业人士关注。

数据处理饮食指数菌群多样性分析 Microbiome microbiota

PNAS：在菌株水平快速区分细菌的新方法

本文报道了利用质谱分析菌落的蛋白质和代谢产物，进行快速的菌株鉴定的新方法。本方法将蛋白质分析和代谢产物分析进行联用，通过数据分析，可鉴别已知菌种的种内差异，也可对未知环境菌群中的可培养菌株进行种间、种内区分，而且具有高效、简便的特点。但该方法的局限性，在于依赖细菌培养。

菌株鉴定质谱分析数据处理 Rawee Teanpaisan Nuntiya Pahumunto

抗生素耐药基因

Microbiome：新方法预测ARG，更准确

弗吉尼亚理工学院Zhang Liqing主导，开发了一种新的基于深度学习的方法，以从宏基因组数据中鉴定抗生素耐药基因，并证明了该方法的优越性，该研究在近期的Microbiome[IF：8.496]上线，推荐专业人士参考。

抗生素耐药基因数据处理深度学习 antibiotic resistance Deep learning