菌株鉴定

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菌株鉴定

文章数：3篇

细菌内生孢子

Nature子刊：食用昆虫的健康风险

可食用昆虫是指能用于人类食用的昆虫，昆虫不仅含有丰富的有机物质，例如蛋白质、脂肪、碳水化合物，无机物质如各种盐类，钾、钠、磷、铁、钙的含量也很丰富，还有人体所需的游离氨基酸。但在工业化饲养过程中，不可避免地受到各种微生物的污染，而以孢子形式存在的致病菌是可食用昆虫的主要问题。发表在Nature Food上的的一项研究对黄粉虫和家蟋蟀体内的细菌内生孢子和特定病毒进行了检测，表明存在蜡状芽孢杆菌产生毒素Cereulide的健康风险，而病毒传播风险较低。随着工业昆虫生产方法向自动化和规模化方向发展，建议对本研究中未考虑的其他病毒和昆虫物种进行检测，以充分评估其健康风险。

细菌内生孢子病毒食品安全芽孢杆菌菌株鉴定

PNAS：在菌株水平快速区分细菌的新方法

本文报道了利用质谱分析菌落的蛋白质和代谢产物，进行快速的菌株鉴定的新方法。本方法将蛋白质分析和代谢产物分析进行联用，通过数据分析，可鉴别已知菌种的种内差异，也可对未知环境菌群中的可培养菌株进行种间、种内区分，而且具有高效、简便的特点。但该方法的局限性，在于依赖细菌培养。

菌株鉴定质谱分析数据处理 Rawee Teanpaisan Nuntiya Pahumunto

Nature子刊重磅：从宏基因组信息鉴别菌株信息！

① 本文介绍了一种利用宏基因组数据完成菌株鉴别的工具——PanPhlAn；② PanPhlAn根据一个物种的泛基因组，确定在一个物种的不同菌株中有无哪些基因，可得到菌株功能及其致病潜能；③ PanPhlAn能识别造成疾病爆发的菌株，且可对已知菌株和新菌株进行鉴定和比较；④ 结合转录组数据，PanPhlAn能分析相应菌株在复杂的群落中的转录活性；⑤ PanPhlAn克服了宏基因组组装相关的局限性，即使对于参考基因组很少的物种，也能很好地进行菌株鉴定。

宏基因组菌株鉴定