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eggNOG
文章数:2篇
数据库
eggNOG 5—蛋白功能层级注释数据库重大更新
eggNOG是一个公共数据库,包含了直接同源关系、基因进化史和功能注释。本次仅从4.5更新到5.0版,数据量就增加了一倍,共计算了分布在379个分类水平上的4.4百万个直系同源群(OGs),以及它们的相关序列比对、系统发育、HMM模型和功能描述,同时改进了在线使用的易用性。
数据库
功能基因注释
eggNOG
宏基因组
参考基因集
eggNOG
高速宏基因组功能注释工具eggNOG-Mapper
eggNOG-mapper是一款又快又准的功能基因注释工具,比传统的BLAST或InterProScan方法的注释速度提高2到15倍,同时进一步提高了回收率和降低假阳性率,是目前宏基因组基因注释中的主流方法之一,强烈推荐。
eggNOG
功能注释
同源基因
鸟枪法宏基因组学
功能基因注释